ISO 16578:2013
(Main)Molecular biomarker analysis — General definitions and requirements for microarray detection of specific nucleic acid sequences
Molecular biomarker analysis — General definitions and requirements for microarray detection of specific nucleic acid sequences
ISO 16578:2013 defines terms for the detection of nucleic acid sequence of interest using DNA microarrays for detection of nucleic acid. It specifies the verification processes and parameters for molecular biology analysis, including the detection and identification of specific nucleic acid sequences. ISO 16578:2013 provides recommendations and protocol for microarray design and manufacture, validation of hybridization specificity, interlaboratory validation of qualitative methods, determination of limits of detection for a microarray, determination of range of reliable signals, and criteria to assessing technical performance of the microarray platform.
Analyse moléculaire des biomarqueurs — Définitions générales et exigences relatives à la détection sur microréseaux de séquences d'acides nucléiques spécifiques
L'ISO 16578:2013 définit des termes relatifs à la recherche de séquences d'acides nucléiques d'intérêt à l'aide de microréseaux d'ADN pour la détection d'acides nucléiques. Elle est applicable à toutes les méthodes qui utilisent des microréseaux pour la détection d'acides nucléiques. Elle spécifie les paramètres et procédés de vérification utilisés en analyse de biologie moléculaire, y compris pour la recherche et l'identification de séquences d'acides nucléiques spécifiques. L'ISO 16578:2013 a été élaborée afin de fournir des recommandations et un protocole pour: la conception et la fabrication d'un microréseau; la validation de la spécificité d'hybridation; la validation interlaboratoires des méthodes qualitatives; la détermination des limites de détection pour un microréseau; la détermination d'une plage de signaux fiables; les critères d'évaluation des performances techniques du support de microréseau.
General Information
Relations
Buy Standard
Standards Content (Sample)
МЕЖДУНАРОДНЫЙ ISO
СТАНДАРТ 16578
Первое издание
2013-11-15
Методы анализа молекулярного
биомаркера. Общие определения и
требования к микрочипам для
обнаружения специфических
последовательностей нуклеиновой
кислоты
Molecular biomarker analysis - General definitions and requirements for
microarray detection of specific nucleic acid sequences
Ответственность за подготовку русской версии несёт GOST R
(Российская Федерация) в соответствии со статьёй 18.1 Устава ISO
Ссылочный номер
ISO_16578:2013(R)
©
ISO 2013
---------------------- Page: 1 ----------------------
ISO 16578:2013(R)
Отказ от ответственности при работе в PDF
Настоящий файл PDF может содержать интегрированные шрифты. В соответствии с условиями лицензирования, принятыми
фирмой Adobe, этот файл можно распечатать или смотреть на экране, но его нельзя изменить, пока не будет получена
лицензия на установку интегрированных шрифтов в компьютере, на котором ведется редактирование. В случае загрузки
настоящего файла заинтересованные стороны принимают на себя ответственность за соблюдение лицензионных условий
фирмы Adobe. Центральный секретариат ISO не несет никакой ответственности в этом отношении.
Adobe – торговый знак фирмы Adobe Systems Incorporated.
Подробности, относящиеся к программным продуктам, использованным для создания настоящего файла PDF, можно найти в
рубрике General Info файла; параметры создания PDF были оптимизированы для печати. Были приняты во внимание все
меры предосторожности с тем, чтобы обеспечить пригодность настоящего файла для использования комитетами-членами
ISO. В редких случаях возникновения проблемы, связанной со сказанным выше, просьба проинформировать Центральный
секретариат по адресу, приведенному ниже.
ДОКУМЕНТ ЗАЩИЩЕН АВТОРСКИМ ПРАВОМ
© ISO 2013
Все права сохраняются. Если не указано иное, никакую часть настоящей публикации нельзя копировать или использовать в
какой-либо форме или каким-либо электронным или механическим способом, включая фотокопии и микрофильмы, без
предварительного письменного согласия ISO, которое должно быть получено после запроса о разрешении, направленного по
адресу, приведенному ниже, или в комитет-член ISO в стране запрашивающей стороны.
ISO copyright office
Case postale 56 • CH-1211 Geneva 20
Tel. + 41 22 749 01 11
Fax + 41 22 749 09 47
E-mail copyright @ iso.org
Web www.iso.org
Опубликовано в Швейцарии
ii © ISO 2013 – Все права сохраняются
---------------------- Page: 2 ----------------------
ISO 16578:2013(R)
Предисловие
Международная организация по стандартизации (ISO) является всемирной федерацией национальных
организаций по стандартизации (комитетов-членов ISO). Разработка международных стандартов
обычно осуществляется техническими комитетами ISO. Каждый комитет-член, заинтересованный в
деятельности, для которой был создан технический комитет, имеет право быть представленным в этом
комитете. Международные правительственные и неправительственные организации, имеющие связи с
ISO, также принимают участие в этой работе. ISO работает в тесном сотрудничестве с Международной
электротехнической комиссией (IEC) по всем вопросам стандартизации в области электротехники.
Процедуры, используемые для разработки этого документа и тех, которые предназначены для его
дальнейшего ведения, описаны в Директивах ISO/IEC, Часть 1. В частности, следует отметить
различные критерии утверждения, необходимые для различных типов документов ISO. Этот документ
был подготовлен в соответствии с редакционными правилами Директив ISO/IEC, Часть 2.
www.iso.org/directives.
Следует иметь в виду, что некоторые элементы данного стандарта могут быть объектом патентных
прав. ISO не несет ответственности за идентификацию какого-либо одного или всех таких патентных
прав. Информация о любых патентных правах, выявленных в ходе разработки документа, будет
представлена в разделе Введение и/или в перечне полученных патентных деклараций ISO.
www.iso.org/patents.
Любое торговое наименование, используемое в данном документе, дается для удобства
пользователей и не является официальным мнением.
Данный документ разработан Техническим комитетом ISO/ТC 34, Пищевые продукты, SC 16,
Горизонтальные методы анализа молекулярного биомаркера.
© ISO 2013 – Все права сохраняются iii
---------------------- Page: 3 ----------------------
ISO 16578:2013(R)
Введение
Основное внимание в настоящем стандарте уделяется методологиям на основе ДНК-микрочипов.
ДНК-микрочипы - это технология, используемая в молекулярной биологии и позволяющая
одновременно обнаружить несколько последовательностей нуклеиновых кислот. Этот метод особенно
подходит для определения последовательностей исследуемых нуклеиновых кислот, а также для
измерения уровней экспрессии генов. Микрочип и его производные технологии были разработаны для
применения в области анализа пищевых продуктов [для анализа генетически модифицированных
организмов (ГМО), определения биомаркеров и др.]. Хотя стандартизированные параметры,
необходимые для применения методов на основе ДНК-микрочипов, находятся в стадии рассмотрения,
например, контроль качества микрочипов (MAQC) и минимальная информация об испытании
микрочипов (MIAME), необходимо сформировать минимальные требования для интерпретации
результатов.
Таким образом, целью настоящего стандарта является предоставление рекомендаций и требований
для обнаружения последовательностей исследуемых нуклеиновых кислот с помощью микрочипов. Эта
информация касается
- определения подходов к проверке достоверности методов на основе ДНК микрочипов, и
- определения общих принципов, используемых для осуществления этих лабораторных анализов.
Технология микрочипов развилась из блоттинга по Саузерну, основным принципом является
гибридизация между двумя цепочками ДНК по свойству взаимодополняемости последовательностей
нуклеиновых кислот. ДНК-микрочип представляет собой набор микроскопических точек ДНК,
прикрепленных к твердой подложке или кодированным шарикам. Разработка анализа микрочипов
обычно необходима для создания ДНК-зондов, установки ДНК-зонда на твердую подложку, маркировки
последовательностей нуклеиновой кислоты-мишени, гибридизации мишеней с ДНК-зондом, и для
разработки соответствующей системы обнаружения. Существует много видов анализов и множество
способов для изготовления микрочипов. В соответствии с используемыми методами маркировки
мишеней гибридизация может быть обнаружена с помощью электрических, колориметрических и/или
флуоресцентных сигналов.
На момент публикации настоящего международного стандарта были разработаны лучшие практики и
стандарты для представления данных и минимальной информации для сопоставления и
воспроизводимости данных микрочипов. Тем не менее, лишь немногие опубликованные работы все
еще сфокусированы на надежности и сопоставимости любых заданных платформ для микрочипов, и в
этом случае, вероятно, недостаточно проверки достоверности в одной лаборатории. Скорее, должна
быть принята межлабораторная проверка достоверности метода в соответствии с конкретными
международными стандартами.
ПРИМЕЧАНИЕ 1 Контроль качества микрочипов (MAQC) предоставляет отличный ресурс, чтобы определить
лучшие практики на основе микрочипов, включая использование стандартных образцов, сбор данных и форматы.
См. http://www.fda.gov/ScienceResearch/BioinformaticsTools/MicroarrayQualityControlProject/default.htm
ПРИМЕЧАНИЕ 2 Минимальная информация об испытании микрочипов (MIAME) путем установления единых
стандартов описания данных микрочипов, систем управления и передачи данных, а также общественных фондов
для хранения и получения данных помогает в описании подробной информации, которую должны предоставить
исследователи, чтобы объяснить процедуры и биологические цели данных с микрочипов.
См. http://www.mged.org/Workgroups/MIAME/miame.html
Общие требования для обнаружения ДНК также изложены в следующих международных стандартах:
ISO 21569, ISO 21570, ISO 21571, ISO 22174 и ISO 24276.
iv © ISO 2013 – Все права сохраняются
---------------------- Page: 4 ----------------------
МЕЖДУНАРОДНЫЙ СТАНДАРТ ISO 16578:2013(R)
Методы анализа молекулярного биомаркера. Общие
определения и требования к микрочипам для обнаружения
специфических последовательностей нуклеиновой кислоты
1 Область применения
Настоящий международный стандарт определяет условия для обнаружения последовательности исследуемой
нуклеиновой кислоты с использованием ДНК-микрочипов для выявления нуклеиновой кислоты.
Настоящий международный стандарт распространяется на все методы, которые используют
микрочипы для выявления нуклеиновых кислот.
Настоящий международный стандарт устанавливает методы проверки достоверности и параметры для
молекулярного биологического анализа, в том числе для обнаружения и идентификации
специфических последовательностей нуклеиновых кислот.
Настоящий международный стандарт представляет рекомендации и протокол для
― разработки и производства микрочипов,
― проверки специфичности гибридизации,
― межлабораторной проверки достоверности качественных методов,
― определения пределов обнаружения для микрочипов,
― определения диапазона надежных сигналов и
― определения критериев оценки технических характеристик платформы для микрочипов.
Стандарт не распространяется на следующие протоколы:
― процесс количественного измерения;
― требования к подготовке проб перед испытанием ДНК-микрочипов.
2 Нормативные ссылки
Следующие нормативные документы необходимы для применения настоящего международного
стандарта. Для жестких ссылок применяется только то издание, на которое дается ссылка. Для
плавающих ссылок применяется самое последнее издание нормативного ссылочного документа
(включая любые изменения).
ISO 5725-1, Точность (правильность и прецизионность) методов и результатов измерений. Часть
1. Общие принципы и определения
ISO 5725-2, Точность (правильность и прецизионность) методов и результатов измерений. Часть 2.
Основной метод определения повторяемости и воспроизводимости стандартного метода измерения
ISO 22174, Микробиология пищевых продуктов и кормов для животных. Полимеразная цепная реакция
(ПЦР) для обнаружения патогенных пищевых микроорганизмов. Общие требования и определения
© ISO 2013 – Все права сохраняются 1
---------------------- Page: 5 ----------------------
ISO 16578:2013(R)
ISO 24276, Продукты пищевые. Методы анализа для обнаружения генетически модифицированных
организмов и полученных из них продуктов. Общие требования и определения
ISO/IEC 17025:2005, Общие требования к компетентности испытательных и калибровочных лабораторий
ISO/IEC Guide 99, Международный словарь по метрологии. Основные и общие понятия и
соответствующие термины (VIM)
3 Термины и определения
Для целей настоящего документа используются термины и определения из ISO 5725 1, ISO 5725 2,
ISO/IEC 17025, ISO/IEC Guide 99, ISO 22174 и ISO 24276 и последующие.
3.1
предел обнаружения платформы для микрочипов
limit of detection for microarray platform
LODP
минимальная относительная величина внешнего стандарта измерения (или стандартного образца),
которая может быть обнаружена экспериментально при уровне достоверности 95%, учитывая
известное (установленное/оцененное) количество копий и/или концентрацию внешнего стандарта
измерения (или стандартного образца)
3.2
диапазон надежного сигнала
range of reliable signal
способность (в пределах заданного диапазона) представить результаты, которые прямо пропорциональны
концентрации и/или числу копий внешнего стандарта измерения (или стандартного образца)
3.3
ДНК-микрочип
ДНК-чип
DNA microarray
DNA chip
набор ДНК-зонда, сгруппированный в определенном порядке и закрепленный с большой п
...
INTERNATIONAL ISO
STANDARD 16578
First edition
2013-11-15
Molecular biomarker analysis —
General definitions and requirements
for microarray detection of specific
nucleic acid sequences
Analyse moléculaire des biomarqueurs — Définitions générales et
exigences relatives à la détection sur microréseaux de séquences
d’acides nucléiques spécifiques
Reference number
ISO 16578:2013(E)
©
ISO 2013
---------------------- Page: 1 ----------------------
ISO 16578:2013(E)
COPYRIGHT PROTECTED DOCUMENT
© ISO 2013
All rights reserved. Unless otherwise specified, no part of this publication may be reproduced or utilized otherwise in any form
or by any means, electronic or mechanical, including photocopying, or posting on the internet or an intranet, without prior
written permission. Permission can be requested from either ISO at the address below or ISO’s member body in the country of
the requester.
ISO copyright office
Case postale 56 • CH-1211 Geneva 20
Tel. + 41 22 749 01 11
Fax + 41 22 749 09 47
E-mail copyright@iso.org
Web www.iso.org
Published in Switzerland
ii © ISO 2013 – All rights reserved
---------------------- Page: 2 ----------------------
ISO 16578:2013(E)
Foreword
ISO (the International Organization for Standardization) is a worldwide federation of national standards
bodies (ISO member bodies). The work of preparing International Standards is normally carried out
through ISO technical committees. Each member body interested in a subject for which a technical
committee has been established has the right to be represented on that committee. International
organizations, governmental and non-governmental, in liaison with ISO, also take part in the work.
ISO collaborates closely with the International Electrotechnical Commission (IEC) on all matters of
electrotechnical standardization.
The procedures used to develop this document and those intended for its further maintenance are
described in the ISO/IEC Directives, Part 1. In particular the different approval criteria needed for the
different types of ISO documents should be noted. This document was drafted in accordance with the
editorial rules of the ISO/IEC Directives, Part 2. www.iso.org/directives
Attention is drawn to the possibility that some of the elements of this document may be the subject of
patent rights. ISO shall not be held responsible for identifying any or all such patent rights. Details of
any patent rights identified during the development of the document will be in the Introduction and/or
on the ISO list of patent declarations received. www.iso.org/patents
Any trade name used in this document is information given for the convenience of users and does not
constitute an endorsement.
The committee responsible for this document is ISO/TC 34, Food products, Subcommittee SC 16,
Horizontal methods for molecular biomarker analysis.
© ISO 2013 – All rights reserved iii
---------------------- Page: 3 ----------------------
ISO 16578:2013(E)
Introduction
The main focus of this International Standard is DNA microarray-based methodologies.
DNA microarray is a molecular biological technique capable of simultaneous detection of multiple
nucleic acid sequences and is particularly suitable for identifying nucleic acid sequences of interest and
for measuring gene expression levels. Microarray and its derived technology have been developed for
use in the field of food analysis [genetically modified organism (GMO) analysis, biomarker identification,
etc.]. Although the standardized parameters required for DNA microarray-based methods have been
under consideration (such as MAQC and MIAME), it is necessary to generate minimum requirements for
the interpretation of the results.
Therefore, the aim of this International Standard is to provide guidance and requirements for the
detection of nucleic acid sequences of interest by microarrays. This information concerns
— the establishment of validation approaches for methods based on DNA microarray, and
— the definition of general principles employed in carrying out these laboratory analyses.
Microarray technology is evolved from Southern blotting; the core principle is hybridization between
two DNA strands, by the property of complementarities of nucleic acid sequences. A DNA microarray
is a collection of microscopic DNA spots attached to a solid substrate or coded beads. The development
of a microarray assay generally needs to design the probe DNAs, to arrange the probe DNAs onto a
solid substrate, to label the target nucleic acid sequences, to hybridize the targets with the probe DNAs,
and to elaborate an appropriate detection system. Many types of arrays exist and there are many ways
to fabricate microarrays. According to the target labelling techniques used, the hybridization can be
detected by electrical, colorimetric, and/or fluorescence signals.
At the time of publication of the International Standard, best practices and standards for data
representation and minimum information have been developed for comparability and reproducibility of
microarray data. However, only few published work have yet focused on the reliability and comparability
of any given microarray platforms, and a single-laboratory validation would most likely not suffice
in this case. Rather, an interlaboratory method validation should be adopted, according to specific
international guidelines.
NOTE 1 The Microarray Quality Control (MAQC) consortium provides an excellent resource to determine best
microarray practices, including the use of reference material, data assembly, and formats.
See http://www.fda.gov/ScienceResearch/BioinformaticsTools/MicroarrayQualityControlProject/default.htm
NOTE 2 The Minimum Information About a Microarray Experiment (MIAME), by establishing common
standards for describing microarray data, systems for data management and transfer, and public repositories for
data storage and mining, aids in describing the detailed information that researchers should provide to explain
the procedures and biological purposes of their microarray data.
See http://www.mged.org/Workgroups/MIAME/miame.html
General requirements for the detection of DNA are also laid down in the following International
Standards: ISO 21569, ISO 21570, ISO 21571, ISO 22174 and ISO 24276.
iv © ISO 2013 – All rights reserved
---------------------- Page: 4 ----------------------
INTERNATIONAL STANDARD ISO 16578:2013(E)
Molecular biomarker analysis — General definitions and
requirements for microarray detection of specific nucleic
acid sequences
1 Scope
This International Standard defines terms for the detection of nucleic acid sequence of interest using
DNA microarrays for detection of nucleic acid.
This International Standard is applicable to all methods that use microarrays for detection of nucleic acids.
This International Standard specifies the verification processes and parameters for molecular biology
analysis, including the detection and identification of specific nucleic acid sequences.
This International Standard has been developed to provide recommendations and protocol for
— microarray design and manufacture,
— validation of hybridization specificity,
— interlaboratory validation of qualitative methods,
— determination of limits of detection for a microarray,
— determination of range of reliable signals, and
— criteria to assessing technical performance of the microarray platform.
It does not cover the following protocols:
— the process of quantitative measurement;
— the requirements for sample preparation prior to DNA microarray experiments.
2 Normative references
The following documents, in whole or in part, are normatively referenced in this document and are
indispensable for its application. For dated references, only the edition cited applies. For undated
references, the latest edition of the referenced document (including any amendments) applies.
ISO 5725-1, Accuracy (trueness and precision) of measurement methods and results — Part 1: General
principles and definitions
ISO 5725-2, Accuracy (trueness and precision) of measurement methods and results — Part 2: Basic method
for the determination of repeatability and reproducibility of a standard measurement method
ISO 22174, Microbiology of food and animal feeding stuffs — Polymerase chain reaction (PCR) for the
detection of food-borne pathogens — General requirements and definitions
ISO 24276, Foodstuffs — Methods of analysis for the detection of genetically modified organisms and derived
products — General requirements and definitions
ISO/IEC 17025:2005, General requirements for the competence of testing and calibration laboratories
ISO/IEC Guide 99, International vocabulary of metrology — Basic and general concepts and associated
terms (VIM)
© ISO 2013 – All rights reserved 1
---------------------- Page: 5 ----------------------
ISO 16578:2013(E)
3 Terms and definitions
For the purposes of this document, the terms and definitions in ISO 5725-1, ISO 5725-2, ISO/IEC 17025,
ISO/IEC Guide 99, ISO 22174 and ISO 24276 and the following apply.
3.1
limit of detection for microarray platform
LODP
lowest relative quantity of the external measurement standard (or reference material) that can be
detected experimentally at a 95 % confidence level, given a known (determined/estimated) number of
copies and/or concentration of the external measurement standard (or reference material)
3.2
range of reliable signal
ability (within a given range) to provide results that are directly proportional to the concentration
and/or copy number of the external measurement standard (or reference material)
3.3
DNA microarray
DNA chip
solid substrate where a collection of probe DNA arranged in a specific design is attached in a high-density
fashion, directly or indirectly, that assays large amounts of biological material using high-throughput
screening methods
3.4
probe DNA
single-strand nucleic acid defined by its property to target specific nucleic acid sequence by base
complementarities, where the stringency of the binding is linked with the length and nucleic acid
composition of the probes, along with reaction parameters
3.5
platform
device that supports a microarray (or DNA chip) technology
3.6
fluorescence detection
method of detecting hyb
...
NORME ISO
INTERNATIONALE 16578
Première édition
2013-11-15
Analyse moléculaire des
biomarqueurs — Définitions générales
et exigences relatives à la détection
sur microréseaux de séquences
d’acides nucléiques spécifiques
Molecular biomarker analysis — General definitions and requirements
for microarray detection of specific nucleic acid sequences
Numéro de référence
ISO 16578:2013(F)
©
ISO 2013
---------------------- Page: 1 ----------------------
ISO 16578:2013(F)
DOCUMENT PROTÉGÉ PAR COPYRIGHT
© ISO 2013
Droits de reproduction réservés. Sauf indication contraire, aucune partie de cette publication ne peut être reproduite ni utilisée
sous quelque forme que ce soit et par aucun procédé, électronique ou mécanique, y compris la photocopie, l’affichage sur
l’internet ou sur un Intranet, sans autorisation écrite préalable. Les demandes d’autorisation peuvent être adressées à l’ISO à
l’adresse ci-après ou au comité membre de l’ISO dans le pays du demandeur.
ISO copyright office
Case postale 56 • CH-1211 Geneva 20
Tel. + 41 22 749 01 11
Fax + 41 22 749 09 47
E-mail copyright@iso.org
Web www.iso.org
Publié en Suisse
ii © ISO 2013 – Tous droits réservés
---------------------- Page: 2 ----------------------
ISO 16578:2013(F)
Sommaire Page
Avant-propos .iv
Introduction .v
1 Domaine d’application . 1
2 Références normatives . 1
3 Termes et définitions . 2
4 Principe . 3
4.1 Essai sur support de microréseau . 3
4.2 Conception et fabrication de microréseaux . 3
4.3 Validation de la spécificité de l’hybridation . 3
4.4 Validation interlaboratoires des méthodes qualitatives . 4
5 Expression des résultats. 5
5.1 Généralités . 5
5.2 Expression d’un résultat négatif . 5
5.3 Expression d’un résultat positif . 5
5.4 Expression d’un résultat non concluant . 5
6 Rapport d’essai . 6
Bibliographie . 7
© ISO 2013 – Tous droits réservés iii
---------------------- Page: 3 ----------------------
ISO 16578:2013(F)
Avant-propos
L’ISO (Organisation internationale de normalisation) est une fédération mondiale d’organismes
nationaux de normalisation (comités membres de l’ISO). L’élaboration des Normes internationales est
en général confiée aux comités techniques de l’ISO. Chaque comité membre intéressé par une étude
a le droit de faire partie du comité technique créé à cet effet. Les organisations internationales,
gouvernementales et non gouvernementales, en liaison avec l’ISO participent également aux travaux.
L’ISO collabore étroitement avec la Commission électrotechnique internationale (CEI) en ce qui concerne
la normalisation électrotechnique.
Les procédures utilisées pour élaborer le présent document et celles destinées à sa mise à jour sont
décrites dans les Directives ISO/CEI, Partie 1. Il convient, en particulier, de prendre note des différents
critères d’approbation requis pour les différents types de documents ISO. Le présent document a été
rédigé conformément aux règles de rédaction données dans les Directives ISO/CEI, Partie 2, www.iso.
org/directives.
L’attention est appelée sur le fait que certains des éléments du présent document peuvent faire l’objet de
droits de propriété intellectuelle ou de droits analogues. L’ISO ne saurait être tenue pour responsable
de ne pas avoir identifié de tels droits de propriété et averti de leur existence. Les détails concernant les
références aux droits de propriété intellectuelle ou autres droits analogues identifiés lors de l’élaboration
du document sont indiqués dans l’Introduction et/ou sur la liste ISO des déclarations de brevets reçues,
www.iso.org/brevets.
Les éventuelles appellations commerciales utilisées dans le présent document sont données pour
information à l’intention des utilisateurs et ne constituent pas une approbation ou une recommandation.
Le comité chargé de l’élaboration du présent document est l’ISO/TC 34, Produits alimentaires, sous-
comité SC 16, Méthodes horizontales pour l’analyse moléculaire de biomarqueurs.
iv © ISO 2013 – Tous droits réservés
---------------------- Page: 4 ----------------------
ISO 16578:2013(F)
Introduction
La présente Norme internationale porte essentiellement sur les méthodologies basées sur les
microréseaux d’ADN.
Un microréseau d’ADN est une technique de biologie moléculaire permettant de détecter simultanément
de multiples séquences d’acide nucléique. Elle est particulièrement adaptée à l’identification de
séquences d’acides nucléiques d’intérêt et à l’étude des profils d’expression des gènes. Les microréseaux
et la technologie qui en découle ont été développés pour être utilisés dans le domaine de l’analyse
des aliments [par exemple l’analyse d’organismes génétiquement modifiés (OGM), l’identification de
biomarqueurs, etc.]. Bien que les paramètres normalisés requis pour appliquer les méthodes basées
sur les microréseaux aient été étudiés (par exemple MAQC et MIAME), il est nécessaire de définir des
exigences minimales concernant l’interprétation des résultats.
De ce fait, la présente Norme internationale a pour objectif de fournir des lignes directrices et d’indiquer
des exigences pour la recherche de séquences d’acides nucléiques d’intérêt sur microréseaux. Ces
informations concernent:
— l’établissement de procédures de validation des méthodes basées sur les microréseaux d’ADN;
— la définition des principes généraux mis en œuvre lors de la réalisation de ces analyses en laboratoire.
La technologie des microréseaux est issue des transferts d’ADN; son principe central réside dans
l’hybridation de deux brins d’ADN, en vertu de la complémentarité des séquences d’acide nucléique. Un
microréseau d’ADN est une accumulation de taches microscopiques d’ADN fixées sur un substrat solide
ou des billes codées. La mise au point d’un essai sur microréseau requiert en général de concevoir les
sondes ADN, de les mettre en place sur un substrat solide, de marquer les séquences d’acides nucléiques
cibles, d’hybrider les cibles avec les sondes ADN et d’élaborer un système de détection approprié. Il
existe de nombreux types de réseaux et quantité de moyens de fabriquer des microréseaux. Selon les
techniques de marquage des cibles mises en œuvre, l’hybridation peut être détectée par des signaux
électriques, colorimétriques, et/ou de fluorescence.
Au moment de la publication de la présente Norme internationale, des pratiques optimisées et des normes
pour la représentation des données et l’indication des informations minimales ont été développées afin
d’assurer la comparabilité et la reproductibilité des données obtenues sur microréseaux. Cependant,
seules quelques publications se sont penchées sur la fiabilité et la comparabilité de supports de
microréseaux déterminés et il est fort probable qu’en l’occurrence, une validation dans un seul laboratoire
ne serait pas suffisante. Il convient plutôt d’adopter une validation interlaboratoires de la méthode, en
conformité avec des lignes directrices internationales spécifiques.
NOTE 1 Le consortium de Contrôle qualité des microréseaux [Microarray Quality Control (MAQC) consortium]
fournit d’excellentes ressources pour déterminer des pratiques optimisées de la technologie des microréseaux, y
compris l’utilisation d’un matériau de référence, l’organisation des données et les présentations.
Voir http://www.fda.gov/ScienceResearch/BioinformaticsTools/MicroarrayQualityControlProject/default.htm
NOTE 2 Les Informations minimales concernant les expériences sur microréseaux (MIAME) via d’une part
l’établissement de normes communes ayant pour objet de décrire les données relatives aux microréseaux et les
systèmes de transfert et de gestion des données, et d’autre part la mise en place des banques publiques dédiées
à l’exploitation et au stockage des données, facilitent la mise à disposition des informations détaillées qu’il est
recommandé aux chercheurs de fournir, pour expliquer les modes opératoires et les objectifs biologiques de leurs
travaux sur les microréseaux.
Voir http://www.mged.org/Workgroups/MIAME/miame.html
Les exigences générales applicables en matière de détection d’ADN sont fixées dans les Normes
internationales suivantes: ISO 21569, ISO 21570, ISO 21571, ISO 22174 et ISO 24276.
© ISO 2013 – Tous droits réservés v
---------------------- Page: 5 ----------------------
NORME INTERNATIONALE ISO 16578:2013(F)
Analyse moléculaire des biomarqueurs — Définitions
générales et exigences relatives à la détection sur
microréseaux de séquences d’acides nucléiques spécifiques
1 Domaine d’application
La présente Norme internationale définit des termes relatifs à la recherche de séquences d’acides
nucléiques d’intérêt à l’aide de microréseaux d’ADN pour la détection d’acides nucléiques.
La présente Norme internationale est applicable à toutes les méthodes qui utilisent des microréseaux
pour la détection d’acides nucléiques.
La présente Norme internationale spécifie les paramètres et procédés de vérification utilisés en
analyse de biologie moléculaire, y compris pour la recherche et l’identification de séquences d’acides
nucléiques spécifiques.
La présente Norme internationale a été élaborée afin de fournir des recommandations et un protocole pour:
— la conception et la fabrication d’un microréseau;
— la validation de la spécificité d’hybridation;
— la validation interlaboratoires des méthodes qualitatives;
— la détermination des limites de détection pour un microréseau;
— la détermination d’une plage de signaux fiables;
— les critères d’évaluation des performances techniques du support de microréseau.
Elle n’aborde pas les protocoles suivants:
— le processus de quantification;
— les exigences relatives à la préparation de l’échantillon avant les expériences sur microréseau d’ADN.
2 Références normatives
Les documents suivants, en tout ou partie, sont référencés de manière normative dans le présent
document et sont indispensables pour son application. Pour les références datées, seule l’édition citée
s’applique. Pour les références non datées, la dernière édition du document de référence s’applique (y
compris les éventuels amendements).
ISO 5725-1, Exactitude (justesse et fidélité) des résultats et méthodes de mesure — Partie 1: Principes
généraux et définitions
ISO 5725-2, Exactitude (justesse et fidélité) des résultats et méthodes de mesure — Partie 2: Méthode de
base pour la détermination de la répétabilité et de la reproductibilité d’une méthode de mesure normalisée
ISO 22174, Microbiologie des aliments — Réaction de polymérisation en chaîne (PCR) pour la recherche de
micro-organismes pathogènes dans les aliments — Exigences générales et définitions
ISO 24276, Produits alimentaires — Méthodes d’analyse pour la détection des organismes génétiquement
modifiés et des produits dérivés — Exigences générales et définitions
ISO/CEI 17025, Exigences générales concernant la compétence des laboratoires d’étalonnages et d’essais
© ISO 20
...
Questions, Comments and Discussion
Ask us and Technical Secretary will try to provide an answer. You can facilitate discussion about the standard in here.