Microbiology of food and animal feeding stuffs — Protocol for the validation of alternative methods

ISO 16140:2003 defines the general principle and the technical protocol for the validation of alternative methods in the field of microbiological analysis of food, animal feeding stuffs and environmental and veterinary samples for the validation of alternative methods which can be used in particular in the framework of the official control, and the international acceptance of the results obtained by the alternative method. It also establishes the general principles of certification of these alternative methods, based on the validation protocol defined in ISO 16140:2003. Where an alternative method is used on a routine basis for internal laboratory use without the requirement to meet (higher) external criteria of quality assurance, a less stringent comparative validation of the alternative method than that set in ISO 16140:2003 may be appropriate.

Microbiologie des aliments — Protocole pour la validation des méthodes alternatives

L'ISO 16140:2003 établit le principe général ainsi que le protocole technique de validation des méthodes alternatives dans le domaine de l'analyse microbiologique des aliments, des produits alimentaires pour animaux et des échantillons environnementaux et vétérinaires, en vue de la validation des méthodes alternatives pouvant être utilisées en particulier dans le cadre du contrôle officiel et de l'acceptation internationale des résultats obtenus avec la méthode alternative. L'ISO 16140:2003 établit également les principes généraux régissant la certification de ces méthodes alternatives, sur la base du protocole de validation défini dans le présent document. Lorsqu'une méthode alternative est utilisée de façon routinière en laboratoire sans qu'il soit nécessaire de répondre à des critères extérieurs (plus exigeants) en matière d'assurance qualité, une validation comparative de la méthode alternative moins restrictive que ce que prévoit l'ISO 16140:2003 peut convenir.

General Information

Status
Withdrawn
Publication Date
29-Apr-2003
Withdrawal Date
29-Apr-2003
Current Stage
9599 - Withdrawal of International Standard
Completion Date
17-Jun-2016
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ISO 16140:2003 - Microbiology of food and animal feeding stuffs -- Protocol for the validation of alternative methods
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ISO 16140:2003 - Microbiologie des aliments -- Protocole pour la validation des méthodes alternatives
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Standards Content (Sample)

INTERNATIONAL ISO
STANDARD 16140
First edition
2003-05-01

Microbiology of food and animal feeding
stuffs — Protocol for the validation of
alternative methods
Microbiologie des aliments — Protocole pour la validation des
méthodes alternatives




Reference number
ISO 16140:2003(E)
©
ISO 2003

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ISO 16140:2003(E)
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ISO 16140:2003(E)
Foreword
ISO (the International Organization for Standardization) is a worldwide federation of national standards bodies
(ISO member bodies). The work of preparing International Standards is normally carried out through ISO
technical committees. Each member body interested in a subject for which a technical committee has been
established has the right to be represented on that committee. International organizations, governmental and
non-governmental, in liaison with ISO, also take part in the work. ISO collaborates closely with the
International Electrotechnical Commission (IEC) on all matters of electrotechnical standardization.
International Standards are drafted in accordance with the rules given in the ISO/IEC Directives, Part 2.
The main task of technical committees is to prepare International Standards. Draft International Standards
adopted by the technical committees are circulated to the member bodies for voting. Publication as an
International Standard requires approval by at least 75 % of the member bodies casting a vote.
Attention is drawn to the possibility that some of the elements of this International Standard may be the
subject of patent rights. ISO shall not be held responsible for identifying any or all such patent rights.
ISO 16140 was prepared by the European Committee for Standardization (CEN) in collaboration with
Technical Committee ISO/TC 34, Food products, Subcommittee SC 9, Microbiology, in accordance with the
Agreement on technical cooperation between ISO and CEN (Vienna Agreement).
Throughout the text of this document, read ".this European Standard." to mean ".this International
Standard.".


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ISO 16140:2003(E)

Contents

page
Foreword. v
Introduction . vi
1 Scope. 1
2 Normative references . 1
3 Terms and definitions. 2
4 General principles for the validation and the certification of alternative methods. 3
5 Qualitative methods - Technical protocol for their validation.4
6 Quantitative methods -Technical protocol for their validation . 14
Annex A (normative)  Specific rules for the acceptance of external results already obtained in a prior
validation scheme . 29
Annex B (informative)  Classification of sample types for validation studies . 31
Annex C (normative)  Use of naturally contaminated samples and preparation of artificially
contaminated samples in validation studies. 34
Annex D (normative)  Duplication of samples for the determination of relative accuracy and of relative
detection level for qualitative methods . 36
Annex E (normative)  Calculation of the confidence intervals associated with the number of samples
tested. 38
Annex F (normative)  Test applied to the examination of discordant results. 39
Annex G (normative)  Points to be considered when selecting strains for testing selectivity . 40
Annex H (normative)  Guidelines for the organisation and conducting collaborative studies. 42
Annex I (normative)  Determination that negative controls are free of target analyte. 45
Annex J (normative)  Replication of samples for interlaboratory studies of qualitative methods . 46
Annex K (normative)  Consideration of data . 48
Annex L (informative)  Interlaboratory study of qualitative methods: criteria of accordance,
concordance and concordance odds ratio . 49
Annex M (normative)  Replication of samples for the determination of relative accuracy of quantitative
methods . 54
Annex N (normative)  Examples of acceptable and unacceptable situations and range of
measurements for the estimation of the regression line for quantitative methods. 56
Annex O (normative)  Assessment of the linearity of quantitative methods by graphical representation. 58
Annex P (normative)  Detection and quantification limits for counts. 59
Annex Q (normative) Robust estimator of dispersion based on the recursive median Sn from
Rousseeuw [6]. 61
Annex R (normative)  Calculations with the regression method. 62
Annex S (normative)  Examples of calculations for quantitative methods . 67
Annex T (normative)  Collaborative study – Ring test results with duplicates. 72
Annex U (informative)  List of symbols and abbreviations . 73
Bibliography . 74
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ISO 16140:2003(E)


Foreword
This document (EN ISO 16140:2003) has been prepared by Technical Committee CEN/TC 275 "Food analysis -
Horizontal methods", the secretariat of which is held by DIN, in collaboration with Technical Committee ISO/TC 34
"Agricultural food products".
This European Standard shall be given the status of a national standard, either by publication of an identical text or
by endorsement, at the latest by November 2003, and conflicting national standards shall be withdrawn at the latest
by November 2003.
The annexes A, C to K and M to T are normative. The annexes B, L and U are informative.
This document contains also a Bibliography.
According to the CEN/CENELEC Internal Regulations, the national standards organizations of the following coun-
tries are bound to implement this European Standard: Austria, Belgium, Czech Republic, Denmark, Finland,
France, Germany, Greece, Hungary, Iceland, Ireland, Italy, Luxembourg, Malta, Netherlands, Norway, Portugal,
Slovakia, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom.
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ISO 16140:2003(E)


Introduction
The need for the food industry to rapidly assess the microbiological quality of raw materials and finished products
and the microbiological status of manufacturing procedures, has led to the development and refinement of alterna-
tive microbiological methods of analysis that are quicker and/or easier to perform than the corresponding reference
method; some can also be automated.
Among these alternative methods, some can yield results that are equivalent to those provided by the reference
method, while others can lead to results that differ appreciably.
The suppliers/producers of the alternative methods, the food and drink industry, the public health services and
other authorities need a reliable common protocol for the validation of such alternative methods. The data gener-
ated can also be the basis for the certification of a method by an independent organisation.
Because of the extent of the methods comparative study described in this standard for use by the organising labo-
ratory, the procedure is sometimes not appropriate for use as an "in house" method for the validation of an alterna-
tive method by an individual laboratory.
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ISO 16140:2003(E)
1 Scope
This document establishes the general principle and the technical protocol for the validation of alter-
native methods in the field of microbiological analysis of food, animal feeding stuff and environmental
and veterinary samples (see 5.1.1.2.1) for:
 the validation of alternative methods which can be used in particular in the framework of the offi-
cial control;
 the international acceptance of the results obtained by the alternative method.
It also establishes the general principles of certification of these alternative methods, based on the
validation protocol defined in this document (see 4.2).
Where an alternative method is used on a routine basis for internal laboratory use without the re-
quirement to meet (higher) external criteria of quality assurance, a less stringent comparative valida-
tion of the alternative method than that set in this standard may be appropriate.
2 Normative references
This European Standard incorporates by dated or undated reference, provisions from other publica-
tions. These normative references are cited at the appropriate places in the text, and the publications
are listed hereafter. For dated references, subsequent amendments to or revisions of any of these
publications apply to this European Standard only when incorporated in it by amendment or revision.
For undated references the latest edition of the publication referred to applies (including amend-
ments).
ISO 3534-1, Statistics – Vocabulary and symbols – Part 1: Probability and general statistical terms.
ISO 5725, Accuracy (trueness and precision) of measurement methods and results.
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ISO 16140:2003(E)
3 Terms and definitions
For the purposes of this European Standard, the following terms and definitions apply:
3.1
alternative method
method of analysis that demonstrates or estimates, for a given category of products, the same analyte
(3.4) as is measured using the corresponding reference method (3.2).
NOTE 1 The method can be proprietary or non commercial, and does not need to cover an entire analysis pro-
cedure, that is from the preparation of samples to the test report.
NOTE 2 The alternative method exhibits attributes appropriate to the users' needs, for example:
 speed of analysis and/or response;
 ease of execution and/or automation;
 analytical properties (precision, accuracy, limit of detection, etc.);
 miniaturisation;
 reduction of cost.
NOTE 3 The term "alternative" is used to refer to the entire "test procedure and reaction system". This term
includes all ingredients whether material or otherwise, required for implementing the method.
3.2
reference method
internationally recognised method and widely accepted.
NOTE For the purpose of this standard, these are International and European Standards and if not existing,
certain national standards of equivalent standing.
3.3
validation of an alternative method
demonstration that adequate confidence is provided that the results obtained by the alternative
method are comparable to those obtained using the reference method
NOTE The word "comparable" is defined in this EN ISO 16140 by a technical protocol adapted to each type
of method (see clauses 5 and 6).
3.4
analyte
component measured by the method of analysis. It may be the microorganism
3.5
qualitative method
method of analysis whose response is either the presence or absence of the analyte (3.4) detected
either directly or indirectly in a certain amount of sample
3.6
quantitative method
method of analysis whose response is the amount of the analyte (3.4) measured either directly (enu-
meration in a mass or a volume), or indirectly (colour absorbance, impedance, etc.) in a certain
amount of sample
2 © ISO 2003 – All rights reserved

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ISO 16140:2003(E)
3.7
methods comparison study
study, performed by the organising laboratory of the alternative method against the reference method
3.8
inter-laboratory study
study of the method’s performance using common samples in several laboratories and under the con-
trol of the organising laboratory
3.9
organising laboratory
laboratory having the qualified staff and skills to perform the method comparison study and organise
the interlaboratory study.
NOTE The availability of an experienced statistician is essential for the analysis of the results.
4 General principles for the validation and the certification of alternative
methods
4.1 Validation protocol
The validation protocol comprises two phases:
 a methods comparison study (3.7) of the alternative method (3.1) against the reference method
(3.2) carried out in the organizing laboratory;
 an interlaboratory study (3.8) of each of the two methods.
If appropriate, the two phases may be undertaken in parallel.
The technical rules for performing the methods comparison study and the interlaboratory study are
given in clauses 5 and 6, depending upon whether the alternative method is qualitative or quantitative
in nature.
If the alternative method has already been validated and meets the requirements set by another or-
ganisation, specific rules are defined in annex A for accepting the results of this prior validation.
4.2 Principles of the certification
4.2.1 If a subsequent certification of the alternative method is required, the two following principles
shall also be applied (in addition to 4.1):
Details on the organisation of the certification (management of the method comparison study and the
interlaboratory study, all the different bodies involved including the expert laboratory – designated in
this standard as the "organising laboratory"- the reviewers, the certification body, etc) are provided [8]
by the certification body.
4.2.2 The manufacturer shall apply a quality system covering the production line of the product for
which the certification is sought and based on the appropriate European Standard relative to quality
systems or other equivalent international standard (for example EN ISO 9001).
In granting the certification, the certification organisation shall take into account the existence of any
quality system certificate issued by a certification body accredited for quality systems.
4.2.3 A regular verification of the quality of the certified method shall be undertaken after the certi-
fication is granted. An audit is to be performed regularly to verify that the following are still met:
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ISO 16140:2003(E)
 the quality assurance requirements, (see 4.2.1);
 the product's production control requirements, (see 4.2.1).
In addition to the general requirements of the appropriate European Standard relative to the quality
system, the manufacturer presents regularly to the certification organisation updated documentation
that take into account any modification made to the product or production process which may affect
the instructions for using the method and/or the method’s performance. The certification organisation
then decides whether these modifications affect the certification.
5 Qualitative methods - Technical protocol for their validation
5.1 Methods comparison study
5.1.1 Relative accuracy, relative specificity and relative sensitivity
5.1.1.1 Terms and definitions
For the purposes of this European Standard, the following terms and definitions apply.
AC
5.1.1.1.1 relative accuracy ( )
degree of correspondence between the response obtained by the reference method and the response
1)
obtained by the alternative method on identical samples (see 5.1.1.3.1.).
NOTE The term "relative accuracy" used here is complementary to the "accuracy" and “trueness” as defined in
ISO 5725-1 and ISO 3534-1. These state that accuracy is "the closeness of agreement between a test result and
the accepted reference value", and that the trueness is "the closeness of agreement between the average value
obtained from a large series of test results and an accepted reference value". For the purpose of this standard,
the accepted reference value is chosen as the value obtained by the reference method. Thus, the term "relative"
implies that the reference method does not automatically provide the accepted reference value.
5.1.1.1.2 positive deviation (PD)
The alternative method becomes a false positive when it presents a positive deviation if it gives a
positive result when the reference method gives a negative result.
A positive deviation becomes a false positive result when the true result can be proven as being nega-
tive.
A positive deviation is considered as a true positive when the true result can be proven as being posi-
tive.
5.1.1.1.3 negative deviation (ND)
The alternative method presents a negative deviation if it gives a negative result when the reference
method gives a positive result.
A negative deviation becomes a false negative result when the true result can be proved as being
positive.

1)
Difficult to achieve if the pre-enrichment steps are different.
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ISO 16140:2003(E)
5.1.1.1.4 relative sensitivity (SE)
ability of the alternative method to detect the analyte when it is detected by the reference method
(see 5.1.1.3.1.).
5.1.1.1.5 relative specificity (SP)
ability of the alternative method to not detect the analyte when it is not detected by the reference
method (see 5.1.1.3.1.).
5.1.1.2 Measurement protocol
5.1.1.2.1 Food samples
It is of the highest priority to find food samples naturally contaminated with the analyte to be detected
for the validation.
If it is sought to validate the method for all foods, study five categories of food. This number may be
reduced to 1, 2, 3 or 4 categories if the validation of alternative method is restricted to these stated
categories, at the producer's request. The recommended categories are listed in annex B.
Appropriate environmental samples may be included as one category. Veterinary samples may be
treated as another category (see annex B).
It is desirable that food samples come from as wide a distribution as possible in order to reduce any
bias from local food specialities and broaden the range of validation.
When analysing naturally contaminated samples, the range and distribution of contamination of the
samples should be representative of the levels usually found in that product but with emphasis on
smaller numbers.
If it is not possible to acquire a sufficient number of naturally contaminated foods for each of the cate-
gories, artificial contamination of food samples is permissible. The method and levels of contamination
should result in samples behaving similarly to naturally contaminated ones. See methods of inocula-
tion and restrictions in annex C.
5.1.1.2.2 Number of samples
The total number of test portions to be analysed is 60 for each food category chosen from the catego-
ries stated in annex B. Within each category, select representative food types and analyse 20 test
portions of each food type by the proposed method and the reference method to produce at least
60 total results for each category by each method. For naturally contaminated food types prepare the
sample as described in annex D. For artificially contaminated food type adjust the inoculation levels to
achieve fractional positive recovery of the test portions analysed by at least one of the methods. Frac-
tional recovery is achieved when some number, but not all, of the test portions are determined to be
positive by one or both methods, alternative method or reference method.
It is desirable to produce approximately 50 % of the results that are positive and 50 % that are nega-
tive. This is, however, a recommendation, not an absolute percentage, provided that some number of
the test portions are positive and some number are negative for the same food type.
5.1.1.2.3 Test sample preparation
The reference and alternative methods shall be performed with, as far as possible, exactly the same
sample.
Thus, if the first stage of the two methods is the same (for example the same pre-enrichment broth),
perform the replication at the second step (case 1, annex D).
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ISO 16140:2003(E)
If this is not the situation, that is the first culture media, methodology or dilutions are different, prepare
paired test portions for analysis. There are two primary methodologies for such preparations.
In the first instance, mix a double weight of sample with an equal weight/volume of sterile water or
other suitable diluents and homogenize very thoroughly. Then divide into two portions taking particular
care to increase the concentration of the primary enrichment by (approximately 10 %) to compensate
for the dilution effect of the diluted, homogenised sample (case 2, annex D).
In the second instance, directly inoculate the food type with a starting inoculum sufficient to allow a
fractional recovery of the micro-organisms in the test portions analysed by at least one of the methods
after the microorganisms have equilibrated in the food type. Then weigh 25 g test portions and pro-
ceed as described in annex D. This may be preferred for liquid products but is acceptable for any food
type provided that the food is properly homogenised.
5.1.1.3 Calculation and interpretation
5.1.1.3.1 Treatment of data
Tabulate the data of the paired results of the reference and alternative methods and calculate the fol-
lowing parameters for each food category (60 samples) according to the Table 1.
Table 1 - Paired results of the reference and alternative method
Responses Reference method positive (R+) Reference method negative (R-)
Alternative method posi- +/+ positive agreement (PA) -/+ positive deviation (PD) (R-/A+)
tive (A+)
Alternative method nega- +/- negative deviation (ND) (A-/R+) -/- negative agreement (NA)
tive (A-)
The calculations shall be performed on a number of negative results obtained by the reference method
which for the results in Table 1 cannot exceed twice the number of positive results; the negative re-
sults being selected if necessary as immediately following a positive result, in the order of analysis of
the samples.
Express the three criteria as follows:
()PA + NA
 AC = ·100 % ;
Relative accuracy:
N
NA
 SP = ·100 % ;
Relative specificity:
N
-
PA
 Relative sensitivity: SE = ·100%
N
+
where
N is the total number of samples (NA + PA + PD +ND);
N is the total number of negative results with the reference method (NA + PD);
-
N is the total number of positive results with the reference method (PA + ND).
+
6 © ISO 2003 – All rights reserved

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ISO 16140:2003(E)
5.1.1.3.2 Confidence intervals
The calculation of confidence intervals associated with the number of samples tested is given in an-
nex E.
5.1.1.3.3 Discordant results
Examine the discordant results as described in annex F (The McNemar test), by using the count of PD
and ND (see 5.1.1.3.1).
When the values for PD and ND are high and almost equal, no statistical difference between the
methods can be detected using the McNemar test. In this case, the organising laboratory shall pay
further attention to explain the reasons for the high values of PD and ND. Moreover, it shows that the
relative accuracy of a method shall never be interpreted by taking into account only the McNemar test.
5.1.1.3.4 Summary of calculation
All the calculations shall be summarised in Table 2:
Table 2 - Calculation of the relative accuracy, the relative sensitivity and the relative specificity
Matrices PA NA ND PD Sum Relative Accuracy N Relative sensitivity N Relative
+ -
AC (%) SE (%) specificity SP
(%)
100·()PA + NA 100·PA 100·NA
N PA + ND NA + PD
N N+ N-
Food cat. 1
Food cat. 2
Food cat. 3
Food cat. 4
Food cat. 5
TOTAL
5.1.1.3.5 Interpretation
A table giving the raw results (that is all the positive and negative results, Table 1) shall be provided.
Taking into account the number of positive deviations and the number of negative deviations, the ca-
pability of the alternative method to give more or fewer true positive results than the reference method
is evaluated.
The report of the study shall distinguish the results obtained with naturally contaminated and artificially
contaminated samples.
The procedure for the artificial contamination of test samples shall be described in the report of the
study.
Data published elsewhere and meeting the conditions defined in annex A may be used for evaluating
the relative accuracy.
© ISO 2003 – All rights reserved 7

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ISO 16140:2003(E)
5.1.2 Relative detection level
5.1.2.1 Definition
For the purpose of this standard, the relative detection level is the smallest number of culturable mi-
croorganisms (3.4) that can be detected in the sample in 50 % of occasions by the alternative and ref-
erence methods.
5.1.2.2 Measurement protocol
Test the following:
 use one food product within each food category chosen from 5.1.1.2.1, depending of the scope of
the validation (see annex B);
 use five different target microorganisms (or less, depending on the scope of the validation) each
one associated with one food category, if possible. (See annex G.1 for the definition of the target
microorganism);
 preferably test five levels (but a minimum of three levels) of one target microorganism per food,
including the negative control, etc. The first level shall be the negative control. The second level
shall be the theoretical detection level. The third level shall be just above the theoretical detection
threshold and any further levels shall be higher than the previous one. A factor of about three
between each concentration in the upper levels could be applied;
 replicate each combination (food product, level of contamination) six times by both the alternative
and reference methods. Perform the division at the level where the two methods differ as illus-
st
trated in annex D. Thus, if the 1 stage of each method is the same (for example the same pre-
nd
enrichment broth), perform the division at the 2 step (case 1, annex D). If this is not the case, i.e.
the first culture media, methodology or dilutions being different, mix a double weight of sample
with an equal w/v of sterile water or other suitable diluent and then divide into two portions;
 apply the complete procedure of the alternative method and the reference method, including the
preparation of the sample. Inoculation of each food sample may be prior t
...

NORME ISO
INTERNATIONALE 16140
Première édition
2003-05-01

Microbiologie des aliments — Protocole
pour la validation des méthodes
alternatives
Microbiology of food and animal feeding stuffs — Protocol for the
validation of alternative methods




Numéro de référence
ISO 16140:2003(F)
©
ISO 2003

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ISO 16140:2003(F)
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ISO 16140:2003(F)
Avant-propos
L'ISO (Organisation internationale de normalisation) est une fédération mondiale d'organismes nationaux de
normalisation (comités membres de l'ISO). L'élaboration des Normes internationales est en général confiée
aux comités techniques de l'ISO. Chaque comité membre intéressé par une étude a le droit de faire partie du
comité technique créé à cet effet. Les organisations internationales, gouvernementales et non
gouvernementales, en liaison avec l'ISO participent également aux travaux. L'ISO collabore étroitement avec
la Commission électrotechnique internationale (CEI) en ce qui concerne la normalisation électrotechnique.
Les Normes internationales sont rédigées conformément aux règles données dans les Directives ISO/CEI,
Partie 2.
La tâche principale des comités techniques est d'élaborer les Normes internationales. Les projets de Normes
internationales adoptés par les comités techniques sont soumis aux comités membres pour vote. Leur
publication comme Normes internationales requiert l'approbation de 75 % au moins des comités membres
votants.
L'attention est appelée sur le fait que certains des éléments du présent document peuvent faire l'objet de
droits de propriété intellectuelle ou de droits analogues. L'ISO ne saurait être tenue pour responsable de ne
pas avoir identifié de tels droits de propriété et averti de leur existence.
L'ISO 16140 a été élaborée par le Comité européen de normalisation (CEN) en collaboration avec le comité
technique ISO/TC 34, Produits alimentaires, sous-comité SC 9, Microbiologie, conformément à l'Accord de
coopération technique entre l'ISO et le CEN (Accord de Vienne).
Tout au long du texte du présent document, lire «… la présente Norme européenne …» avec le sens de
«… la présente Norme internationale …».

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Sommaire
Avant-propos vi
Introduction vii
1 Domaine d'application 1
2 Références normatives 1
3 Termes et définitions 1
4 Principes généraux de la validation et de la certification des méthodes
alternatives 3
5 Méthodes qualitatives – Protocole technique de validation 5
6 Méthodes quantitatives – Protocole technique de validation 18
Annexe A (normative) Règles spécifiques relatives à l'acceptation de résultats
externes obtenus dans le cadre d'un programme de validation antérieur 38
Annexe B (informative) Classification des types d'échantillons pour les études
de validation 40
Annexe C (normative) Utilisation d'échantillons naturellement contaminés et
préparation d'échantillons artificiellement contaminés dans les études
de validation 43
Annexe D (normative) Duplication des échantillons pour la détermination de
l'exactitude relative et du niveau de détection relatif des méthodes
qualitatives 45
Annexe E (normative) Calcul des intervalles de confiance associés au nombre
d'échantillons soumis à essai 47
Annexe F (normative) Essai utilisé pour l'examen des résultats discordants 48
Annexe G (normative) Aspects à prendre en compte lors du choix des souches
pour établir la sélectivité 49
Annexe H (normative) Lignes directrices relatives à l'organisation et à la
gestion des études collaboratives 51
Annexe I (normative) Détermination de l'absence de l'analyte cible dans les
témoins négatifs 54
Annexe J (normative) Réplication des échantillons pour les études
interlaboratoires des méthodes qualitatives 55
Annexe K (normative) Examen des données 57
Annexe L (informative) Etude interlaboratoire de méthodes qualitatives : critères
d’accord, de concordance et de ratio de chances de concordance 58
Annexe M (normative) Réplication des échantillons pour la détermination de
l'exactitude relative des méthodes quantitatives 64
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Annexe N (normative) Exemples de répartitions acceptables et inacceptables et
domaines de mesures pour l'estimation de la droite de régression dans
le cadre des méthodes quantitatives 66
Annexe O (normative) Evaluation de la linéarité des méthodes quantitatives par
représentation graphique 68
Annexe P (normative) Limites de détection et de quantification des
dénombrements 69
Annexe Q (normative) Estimateur robuste de la dispersion sur la base de la
médiane récursive S de Rousseeuw [6] 71
n
Annexe R (normative) Calculs avec la méthode de régression 72
Annexe S (normative) Exemples de calculs pour les méthodes quantitatives 78
Annexe T (normative) Etude collaborative - Résultats d'essai circulaire avec
réplicats 83
Annexe U (informative) Liste des symboles 84
Bibliographie 85
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Avant-propos
Le présent document (EN ISO 16140:2003) a été élaboré par le Comité Technique
CEN/TC 275 “Analyse des produits alimentaires - Méthodes horizontales”, dont le
secrétariat est tenu par le DIN, en collaboration avec le Comité Technique ISO/TC 34
“Produits alimentaires”.
Cette Norme européenne devra recevoir le statut de norme nationale, soit par publication
d'un texte identique, soit par entérinement, au plus tard en novembre 2003, et toutes les
normes nationales en contradiction devront être retirées au plus tard en novembre 2003.
Les annexes A, C à K et M à T sont normatives. Les annexes B, L et U sont informatives.
La présente norme européenne contient également une bibliographie.
Selon le Règlement Intérieur du CEN/CENELEC, les instituts de normalisation nationaux
des pays suivants sont tenus de mettre cette Norme européenne en application :
Allemagne, Autriche, Belgique, Danemark, Espagne, Finlande, France, Grèce, Hongrie,
Irlande, Islande, Italie, Luxembourg, Malte, Norvège, Pays-Bas, Portugal, République
Tchèque, Royaume-Uni, Slovaquie, Suède et Suisse.
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Introduction
Le besoin que connaît l’industrie alimentaire d'évaluer rapidement la qualité
microbiologique des produits bruts, des produits finis et l’état microbiologique des
méthodes de fabrication (procédé de fabrication et environnement), a mené à l'élaboration
et au perfectionnement des méthodes d’analyse microbiologiques alternatives plus rapides
et plus faciles à réaliser que la méthode de référence correspondante. Certaines méthodes
peuvent même être automatisées.
Certaines méthodes alternatives peuvent aboutir à des résultats identiques à ceux obtenus
avec la méthode de référence. D’autres en revanche peuvent aboutir à des résultats
sensiblement différents.
Les fournisseurs / producteurs des méthodes alternatives, l’industrie des aliments et des
boissons, les services de santé publique et les autorités compétentes en matière
d’agriculture ont besoin d’un protocole commun et fiable permettant de valider ces
méthodes alternatives. Les données obtenues peuvent également constituer la base de la
certification d’une méthode par un organisme indépendant.
La longueur de l’étude comparative des méthodes décrite ci-après à l’usage des
laboratoires organisateurs, rend parfois le présent document peu pratique pour un usage
par un laboratoire individuel en vue de la mise en place d’une validation interne de
méthode alternative.
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ISO 16140:2003(F)
1 Domaine d'application
Le présent document établit le principe général ainsi que le protocole technique de
validation des méthodes alternatives dans le domaine de l’analyse microbiologique des
aliments, des produits alimentaires pour animaux, et des échantillons environnementaux et
vétérinaires (5.1.1.2.1) en vue de :
 la validation des méthodes alternatives pouvant être utilisées en particulier dans le
cadre du contrôle officiel ;
 l'acceptation internationale des résultats obtenus avec la méthode alternative.
Elle établit également les principes généraux régissant la certification de ces méthodes
alternatives, sur la base du protocole de validation défini dans le présent document (voir
4.2).
Lorsqu’une méthode alternative est utilisée de façon routinière en laboratoire sans qu’il soit
nécessaire de répondre à des critères extérieurs (plus exigeants) en matière d’assurance
qualité, une validation comparative de la méthode alternative moins restrictive que ce que
prévoit la présente norme peut convenir.
2 Références normatives
Cette Norme européenne comporte par référence datée ou non datée des dispositions
d'autres publications. Ces références normatives sont citées aux endroits appropriés dans
le texte et les publications sont énumérées ci-après. Pour les références datées, les
amendements ou révisions ultérieurs de l'une quelconque de ces publications ne
s'appliquent à cette norme que s'ils y ont été incorporés par amendement ou révision. Pour
les références non datées, la dernière édition de la publication à laquelle il est fait
référence s'applique (y compris les amendements).
ISO 3534-1, Statistiques – Vocabulaire et symboles – Partie 1 : Probabilité et termes
statistiques généraux.
ISO 5725, Application de la statistique – Exactitude (justesse et fidélité) des résultats et
méthodes de mesure.
3 Termes et définitions
Pour les besoins de la présente Norme européenne, les termes et définitions suivants
s'appliquent.
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3.1
méthode alternative
méthode d’analyse permettant de déterminer ou d’estimer, pour une catégorie de produits
donnée, le même analyte (3.4) que celui mesuré avec la méthode de référence
correspondante (3.2).
NOTE 1 La méthode peut être breveté ou non. Il n’est pas nécessaire qu’elle couvre l’intégralité du
mode opératoire d’analyse, c'est-à-dire de la préparation des échantillons à la rédaction du rapport
d’essai.
NOTE 2 Une méthode alternative se caractérise par des propriétés adaptées aux besoins des
utilisateurs, par exemple :
 la vitesse d’analyse et/ou de réponse ;
 la facilité de réalisation et/ou d’automatisation ;
 les propriétés analytiques (fidélité, exactitude , limite de détection, etc.) ;
 la miniaturisation ;
 la réduction des coûts.
NOTE 3 L’adjectif « alternatif » se réfère à la totalité du « mode opératoire d’analyse et du
système de réaction ». Ce terme recouvre tous les éléments nécessaires à la mise en œuvre de la
méthode, qu'ils soient matériels ou autre.
3.2
méthode de référence
méthode reconnue internationalement et largement acceptée.
NOTE Pour les besoins de la présente norme, il s’agit des méthodes ISO et CEN, et si elles
n’existent pas, de certaines normes nationales de niveau équivalent.
3.3
validation d’une méthode alternative
démonstration selon laquelle ladite méthode apporte un niveau de confiance approprié, sur
le fait que les résultats obtenus avec la méthode alternative sont comparables aux
résultats obtenus avec la méthode de référence
NOTE Le mot « comparable » est défini dans le présent document par un protocole technique
adapté à chaque type de méthode (voir articles 5 et 6).
3.4
analyte
composant mesuré à l’aide de la méthode d’analyse. Il peut s’agir de microorganismes
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ISO 16140:2003(F)
3.5
méthode qualitative
méthode d’analyse dont la réponse est soit la présence, soit l’absence de l’analyte (3.4)
détecté soit directement soit indirectement dans une quantité d’échantillon donnée
3.6
méthode quantitative
méthode d’analyse dont la réponse est la quantité de l’analyte (3.4) mesurée soit
directement (dénombrement, masse ou volume), soit indirectement (absorption
colorimétrique , impédance, etc.) dans une quantité d’échantillon donnée
3.7
étude comparative des méthodes
étude réalisée par le laboratoire organisateur consistant à comparer la méthode alternative
à la méthode de référence
3.8
étude interlaboratoire
validation des performances de la méthode par l’analyse d’échantillons courants dans
plusieurs laboratoires et sous le contrôle du laboratoire organisateur
3.9
laboratoire organisateur
laboratoire ayant l’expérience et les capacités nécessaires pour réaliser l’étude
comparative des méthodes et organiser l’étude interlaboratoire.
NOTE La présence d’un statisticien expérimenté est essentielle pour l’analyse des résultats.
4 Principes généraux de la validation et de la certification des
méthodes alternatives
4.1 Protocole de validation
Le protocole de validation comprend deux étapes :
 une étude comparative (3.7) de la méthode alternative (3.1) par rapport à la méthode
de référence (3.2), réalisée au sein du laboratoire organisateur ;
 une étude interlaboratoire (3.8) de chacune des deux méthodes.
Si nécessaire, ces deux phases peuvent être menées en parallèle.
Les règles techniques de réalisation de l’étude comparative des méthodes et de l’étude
interlaboratoire sont données en 5 et 6, en fonction de la nature qualitative ou quantitative
de la méthode alternative.
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ISO 16140:2003(F)
Si la méthode alternative a déjà été préalablement validée et si elle est conforme aux
exigences requises par un autre organisme, des règles spécifiques sont définies en
annexe A afin de tenir compte des résultats de cette validation antérieure.
4.2 Principes de la certification
4.2.1 Lorsqu’une certification ultérieure de la méthode alternative est nécessaire, les
deux principes suivants doivent également être appliqués (en sus de 4.1).
Les détails concernant l’organisation de la certification (déroulement de l’étude
comparative des méthodes et de l’étude interlaboratoire, l’ensemble des différents
participants incluant le laboratoire expert – désigné dans la présente norme sous le nom
de laboratoire organisateur, les auditeurs, l’organisme de certification, etc.) sont donnés
par l’organisme de certification [8].
4.2.2 Le fabricant doit appliquer un système qualité couvrant la ligne de production du
produit à certifier, et reposant sur la norme européenne appropriée en matière de
systèmes qualité ou sur une norme internationale équivalente (par exemple EN ISO 9001).
Pour accorder la certification, l’organisme de certification doit tenir compte de l’existence
éventuelle de tout certificat de système de qualité, délivré par un organisme de certification
agréé pour les systèmes qualité.
4.2.3 Une vérification régulière de la qualité de la méthode certifiée doit être effectuée
après que la certification a été délivrée. Un audit doit être réalisé régulièrement pour
vérifier que les exigences suivantes sont respectées :
 les exigences relatives à l’assurance qualité (voir 4.2.1) ;
 les exigences relatives au contrôle de la production du produit (voir 4.2.1).
En plus des exigences générales en matière de système qualité relatives à la norme
européenne ou internationale appropriée, le fabricant soumet régulièrement à l’organisme
de certification une documentation mise à jour qui tient compte des modifications
apportées au produit ou au processus de fabrication, modifications susceptibles d’influer
sur les instructions relatives à l’utilisation de la méthode et/ou aux performances de cette
dernière. L’organisme de certification décide alors si ces modifications affectent la
certification.
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ISO 16140:2003(F)
5 Méthodes qualitatives – Protocole technique de validation
5.1 Etude comparative des méthodes
5.1.1 Exactitude relative, spécificité relative et sensibilité relative
5.1.1.1 Termes et définitions
Pour les besoins de la présente norme européenne, les termes et définitions suivantes
s’appliquent :
5.1.1.1.1 Exactitude relative (AC)
Niveau de correspondance entre la réponse obtenue avec la méthode de référence et la
1)
réponse obtenue avec la méthode alternative sur des échantillons identiques .(voir en
5.1.1.3.1).
NOTE Le terme de "exactitude relative" utilisé dans ce contexte vient compléter « l’exactitude »
et la « justesse » définies dans les ISO 5725-1 et ISO 3534-1. Ces dernières définissent l’exactitude
comme « l'étroitesse de l'accord entre le résultat d’essai et la valeur de référence acceptée », et la
justesse comme « l'étroitesse de l'accord entre la valeur moyenne obtenue à partir d’une large série
de résultats d’essai et la valeur de référence acceptée ». Pour les besoins de la présente norme, la
valeur de référence acceptée est choisie comme étant la valeur obtenue par la méthode de
référence. Le terme « relatif » implique donc que la méthode de référence ne fournit pas
automatiquement la valeur de référence acceptée.
5.1.1.1.2 Déviation positive (PD)
La méthode alternative présente une déviation positive si elle donne un résultat positif
lorsque la méthode de référence donne un résultat négatif.
Une déviation positive devient un faux résultat positif lorsqu'il peut être démontré que le
vrai résultat est négatif.
Une déviation positive est considérée comme vrai positif lorsqu'il peut être démontré que
le vrai résultat est positif.
5.1.1.1.3 Déviation négative (ND)
La méthode alternative présente une déviation négative si elle donne un résultat négatif
lorsque la méthode de référence donne un résultat positif.
Une déviation négative devient un faux résultat négatif lorsqu'il peut être démonté que le
vrai résultat est positif.

1)
Difficile à réaliser si les étapes de préenrichissement sont différentes.
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ISO 16140:2003(F)
5.1.1.1.4 Sensibilité relative (SE)
Capacité de la méthode alternative à détecter l'analyte lorsque la méthode de référence le
détecte (voir 5.1.1.3.1).
5.1.1.1.5 Spécificité relative (SP)
Capacité de la méthode alternative à ne pas détecter l'analyte lorsque la méthode de
référence ne le détecte pas. (voir 5.1.1.3.1).
5.1.1.2 Protocole de mesure
5.1.1.2.1 Echantillons d’aliments
Il est très important de trouver des échantillons d’aliments naturellement contaminés par
l’analyte à mesurer pour la validation.
Si l’on cherche à valider la méthode pour tous les aliments, étudier 5 catégories d’aliments.
Ce nombre peut être ramené à 1, 2, 3 ou 4 catégories si la validation de la méthode
alternative est limitée à ces catégories, à la demande du fabricant. Les catégories
recommandées sont énumérées en annexe B.
Les échantillons environnementaux peuvent être inclus comme une catégorie. Les
échantillons vétérinaires peuvent être traités comme un autre catégorie (voir annexe B).
Il est recommandé que l'origine des échantillons d’aliments soit la plus variée possible afin
de limiter les erreurs systématiques liées aux spécialités alimentaires locales et élargir la
plage de validation.
Dans le cadre de l’analyse d’échantillons naturellement contaminés, il convient que la
plage et la répartition de la contamination des échantillons soient représentatives des
niveaux normalement relevés dans ces produits, en se concentrant cependant sur les plus
petits nombres.
S’il est impossible de réunir un nombre suffisant d’aliments naturellement contaminés dans
chacune des catégories, il est autorisé de recourir à la contamination artificielle
d’échantillons d’aliments. Il convient que la méthode et les niveaux de contamination
permettent d’obtenir des échantillons dont le comportement soit identique à celui des
échantillons naturellement contaminés. Voir les méthodes d’ensemencement et les
restrictions en annexe C.
5.1.1.2.2 Nombre d’échantillons
Le nombre total de prises d’essai à analyser est de 60 par catégorie d’aliments choisie
dans les catégories proposées en annexe B. Au sein de chaque catégorie, sélectionner
des types d’aliments représentatifs et analyser 20 prises d’essai à la fois par la méthode
proposée et par la méthode de référence afin d’obtenir au moins 60 résultats par catégorie
et par méthode. Les échantillons de types d’aliments naturellement contaminés doivent
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ISO 16140:2003(F)
être préparés selon le protocole donné en annexe D. Pour les échantillons de types
d’aliments artificiellement contaminés, ajuster le niveau des ensemencements afin
d’obtenir un taux de récupération positif des prises d’essai analysées par au moins une
des méthodes. Le taux de récupération est considéré comme atteint quand un certain
nombre de prises d’essai, pas la totalité, est déterminé comme étant positif par l’une ou les
deux méthodes (méthode de référence et méthode alternative).
Il est préférable d’obtenir environ 50 % de résultats positifs et 50 % de résultats négatifs.
Ceci n’est toutefois qu’une recommandation et non un pourcentage fixe à condition que
certaines prises d’essai soient positives et d’autres négatives pour le même type
d’aliments.
5.1.1.2.3 Préparation de l’échantillon pour essai
Dans la mesure du possible, les méthodes de référence et alternative doivent être
réalisées avec exactement le même échantillon.
Donc, si la première étape des deux méthodes est la même (par exemple même bouillon
de préenrichissement), réaliser la réplication lors de la deuxième étape (cas 1, annexe D).
Si tel n’est pas le cas, c’est-à-dire lorsque les premiers milieux de culture, la méthodologie
ou les dilutions diffèrent, préparer en double des prises d’essai à analyser. Pour ces types
de préparation, il existe deux méthodologies primaires.
Dans le premier cas, mélanger deux fois la masse de l’échantillon à une masse/volume
égale d’eau stérilisée ou d'un autre diluant approprié et homogénéiser de façon
appropriée. Diviser ensuite l’échantillon en deux parts, en prenant particulièrement soin
d’augmenter la concentration de l’enrichissement primaire du milieu (d’environ 10 %) afin
de compenser les effets de dilution de l’étape d’homogénéisation (cas 2, annexe D).
Dans le second cas, ensemencer directement le type d’aliment avec une culture de départ
suffisante pour permettre un taux de récupération des microorganismes dans les prises
d’essai analysées à l’aide d’au moins une des deux méthodes, une fois les
microorganismes bien répartis dans le type d’aliment. Peser ensuite 25 g de prise d’essai
et suivre le protocole décrit en annexe D. Cette façon de faire peut être préférable pour les
produits liquides mais acceptable pour tout autre type d’aliment pour peu que l’aliment ait
été convenablement homogénéisé.
5.1.1.3 Calcul et interprétation
5.1.1.3.1 Traitement des données
Répertorier sous forme de tableau les couples de résultats obtenus avec les méthodes
alternative et de référence et calculer les paramètres suivants pour chaque catégorie
d’aliments (60 échantillons), conformément au Tableau 1.
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ISO 16140:2003(F)
Tableau 1 — Couples de résultats des méthodes de référence et alternative
Réponses Méthode de référence Méthode de référence
positive (R+) négative (R-)
Méthode alternative positive (A+) accord positif +/+ (PA) déviation positive -/+ (PD) (R-/
A+)
Méthode alternative négative (A-) déviation négative +/- (ND) accord négatif -/- (NA)
(A-/ R+)
Le nombre de résultats négatifs obtenus avec la méthode de référence et utilisés pour les
calculs ne doit pas être supérieur au double du nombre de résultats positifs. Si nécessaire,
les résultats négatifs sélectionnés sont ceux qui suivent immédiatement un résultat positif,
dans l’ordre d’analyse des échantillons.
Exprimer les trois critères de la manière suivante :
()PA + NA
 exactitude relative : AC = 100 % ;·
N
NA
 SP = % ;
spécificité relative :·100
N -
PA
 sensibilité relative : SE = 100 %.·
N +

N est le nombre total d’échantillons (NA + PA + PD +ND) ;
N- est le nombre total de résultats négatifs obtenus avec la méthode de
référence (NA + PD) ;
N+ est le nombre total de résultats positifs obtenus avec la méthode de référence
(PA + ND).
5.1.1.3.2 Intervalles de confiance
La méthode de calcul des intervalles de confiance associés au nombre d’échantillons
soumis à l'essai figure en annexe E.
5.1.1.3.3 Résultats discordants
Etudier les résultats discordants, comme décrit en annexe F (Test de Nc Nemar), à l’aide
du décompte de PD et de ND (voir en 5.1.1.3.1).
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ISO 16140:2003(F)
Quand les valeurs de PD et ND sont élevées et quasiment équivalentes, aucune différence
statistique entre les deux méthodes ne peut être mise en évidence par l’utilisation du test
Nc Nemar. Dans ce cas, le laboratoire organisateur doit porter une attention particulière
quant à la raison de ces valeurs de PD et ND élevées. De plus, il est montré que
l’exactitude relative de la méthode ne doit jamais être interprétée en tenant compte
uniquement du test de Nc Nemar.
5.1.1.3.4 Résumé des calculs
Tous les calculs doivent être récapitulés dans le Tableau 2 .
Tableau 2 — Calcul de l'exactitude relative, de la sensibilité relative et de la
spécificité relative
Exactitude Sensibilité Spécificité
relative relative relative
Matrices PA NA ND PD Somme N+ N-
AC (%) SE (%) SP (%)
100·()PA +NA 100·PA 100·NA
N PA + ND NA+PD
N N + N-
Cat. d’alim. 1
Cat. d’alim. 2
Cat. d’alim. 3
Cat. d’alim. 4
Cat. d’alim. 5
TOTAL
5.1.1.3.5 Interprétation
Un tableau présentant les résultats bruts (c’est-à-dire tous les résultats positifs et négatifs,
Tableau 1) doit être fourni.
La capacité de la méthode alternative à donner un nombre de résultats positifs supérieur
ou inférieur à la méthode de référence est évaluée, en tenant compte du nombre de
déviations positives et du nombre de déviations négatives.
Le rapport de l’étude doit présenter de manière distincte les résultats obtenus sur des
échantillons naturellement et artificiellement contaminés.
Le mode opératoire de contamination artificielle des échantillons pour essai doit être décrit
dans le rapport de l’étude.
Des données publiées par d’autres sources et conformes aux conditions décrites à
l’annexe A peuvent être utilisées pour procéder à l’évaluation de l'exactitude relative.
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ISO 16140:2003(F)
5.1.2 Niveau de détection relatif
5.1.2.1 Définition
Pour les besoins de la présente norme, le niveau de détection relatif correspond au
nombre le plus petit de microorganismes cultivables (3.4) qu'il est possible de détecter
dans l'échantillon, avec une probabilité de 50 %, à l'aide des méthodes alternative et de
référence.
5.1.2.2 Protocole de mesure
Soumettre à l'essai ce qui suit :
 utiliser un produit alimentaire de chacune des catégories choisies en 5.1.1.2.1 en
fonction du domaine d’application de la validation (voir annexe B) ;
 utiliser 5 (ou moins, dépendant du domaine d’application de la validation)
microorganismes cible différents, chacun d'eux étant associé à une catégorie
d'aliments, si possible. (Voir annexe G.1 pour la définition du microorganisme cible) ;
 utiliser de préférence 5 niveaux (au minimum 3) d'un microorganisme cible par
aliment, plus le contrôle négatif, etc. Le premier niveau doit être le niveau de contrôle
négatif. Le second niveau doit être le niveau de détection théorique. Le troisième
niveau doit se situer juste au-dessus du seuil de détection théorique et tout autre
niveau doivent être plus élevés que le précédent. Dans les niveaux supérieurs, il est
possible d'appliquer un facteur de 3 entre chaque niveau de concentration ;
 répliquer chaque combinaison (aliment, niveau de contamination) 6 fois avec la
méthode
...

Questions, Comments and Discussion

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