Soil quality -- Sampling -- Part 206: Collection, handling and storage of soil under aerobic conditions for the assessment of microbiological processes, biomass and diversity in the laboratory

This document provides standard procedures for the collection, handling and storage of soil for
subsequent biological testing under aerobic conditions in the laboratory. It applies to the collection,
handling and storage for assessing the effects of soil on microorganisms, invertebrates (e.g. survival,
reproduction, growth, behaviour) and plants (e.g. development, growth). This document is not
applicable to the handling of soil where anaerobic conditions need to be maintained throughout.
This document describes how to minimize the effects of differences in temperature, water content,
and availability of oxygen on aerobic processes as well as the fractionation of soil particles to facilitate
reproducible laboratory determinations[1][2].
This document is mainly applicable to temperate soils. Soils collected from extreme climates (e.g.
permafrost, tropical soils) can require special handling.
NOTE This document does not provide standard procedures on the collection, handling and storage of soil
organisms when assessing the structure and function of soil organism communities in the field. Such standard
procedures are provided in ISO 23611-1 to ISO 23611-6.

Qualité du sol - Échantillonnage - Partie 206: Collecte, manipulation et conservation de sols destinés à l'évaluation de paramètres biologiques fonctionnels et structurels en laboratoire

Le pr�sent document fournit des proc�dures normalis�es pour la collecte, la manipulation et la conservation, dans des conditions a�robies, de sols destin�s � des essais biologiques en laboratoire. Il s'applique � la collecte, la manipulation et la conservation de sols pour l'�valuation de leurs effets sur les micro-organismes, les invert�br�s (par exemple survie, reproduction, croissance, comportement) et les v�g�taux (par exemple d�veloppement, croissance). Le pr�sent document ne s'applique pas � la manipulation de sols lorsque des conditions ana�robies doivent �tre maintenues en permanence.
Le pr�sent document d�crit comment r�duire les cons�quences des diff�rences de temp�rature, de teneur eau et en oxyg�ne disponible sur les processus a�robies, ainsi que le fractionnement des particules du sol, afin d'obtenir des mesures reproductibles en laboratoire[1][2].
Le pr�sent document s'applique principalement aux sols temp�r�s. Les sols collect�s dans des lieux o� les climats sont extr�mes (par exemple le perg�lisol, les sols tropicaux) peuvent n�cessiter une manipulation particuli�re.
NOTE Le pr�sent document ne propose pas de proc�dures normalis�es pour la collecte, la manipulation et la conservation d'organismes du sol lors de l'�valuation de la structure et de la fonction de communaut�s d'organismes du sol sur le terrain. De telles proc�dures normalis�es sont fournies dans l?ISO 23611‑1 � l'ISO 23611‑6.

Kakovost tal - Vzorčenje - 206. del: Zbiranje, ravnanje in shranjevanje vzorcev tal pri aerobnih pogojih za oceno mikrobioloških procesov, biomase in raznolikosti v laboratoriju

Ta dokument podaja standardne postopke za zbiranje, ravnanje in shranjevanje vzorcev tal za nadaljnje biološko preskušanje pri aerobnih pogojih v laboratoriju. Uporablja se tudi za zbiranje, ravnanje in shranjevanje ocene vplivov tal na mikroorganizme, nevretenčarje (npr. preživetje, razmnoževanje, rast, vedenje) in rastline (npr. razvoj, rast). Ta dokument se ne uporablja za ravnanje s tlemi, pri katerih je treba ves čas vzdrževati anaerobne pogoje. Ta dokument opisuje, kako minimizirati učinke razlik v temperaturi, vsebnosti vode in razpoložljivosti kisika na aerobne procese, ter frakcioniranja delcev tal za olajšanje ponovljivosti laboratorijskega določanja [1][2].
Ta dokument se uporablja predvsem za tla z zmerno temperaturo. Vzorci tal, zbrani v ekstremnih podnebjih (npr. permafrost, tropska tla), morda potrebujejo posebno obravnavo. OPOMBA: Ta dokument ne podaja standardnih postopkov zbiranja, ravnanja in shranjevanja talnih organizmov pri ocenjevanju strukture in delovanja skupnostnih talnih organizmov na terenu. Taki standardni postopki so podani v standardih ISO 23611-1 do ISO 23611-6.

General Information

Status
Published
Public Enquiry End Date
09-Aug-2018
Publication Date
29-Jan-2019
Technical Committee
Current Stage
6060 - National Implementation/Publication (Adopted Project)
Start Date
22-Jan-2019
Due Date
29-Mar-2019
Completion Date
30-Jan-2019

RELATIONS

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ISO 18400-206:2018 - Soil quality -- Sampling
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INTERNATIONAL ISO
STANDARD 18400-206
First edition
2018-10
Soil quality — Sampling —
Part 206:
Collection, handling and storage of
soil under aerobic conditions for
the assessment of microbiological
processes, biomass and diversity in
the laboratory
Qualité du sol — Échantillonnage —
Partie 206: Collecte, manipulation et conservation de sols destinés à
l'évaluation de paramètres biologiques fonctionnels et structurels en
laboratoire
Reference number
ISO 18400-206:2018(E)
ISO 2018
---------------------- Page: 1 ----------------------
ISO 18400-206:2018(E)
COPYRIGHT PROTECTED DOCUMENT
© ISO 2018

All rights reserved. Unless otherwise specified, or required in the context of its implementation, no part of this publication may

be reproduced or utilized otherwise in any form or by any means, electronic or mechanical, including photocopying, or posting

on the internet or an intranet, without prior written permission. Permission can be requested from either ISO at the address

below or ISO’s member body in the country of the requester.
ISO copyright office
CP 401 • Ch. de Blandonnet 8
CH-1214 Vernier, Geneva
Phone: +41 22 749 01 11
Fax: +41 22 749 09 47
Email: copyright@iso.org
Website: www.iso.org
Published in Switzerland
ii © ISO 2018 – All rights reserved
---------------------- Page: 2 ----------------------
ISO 18400-206:2018(E)
Contents Page

Foreword ........................................................................................................................................................................................................................................iv

Introduction ..................................................................................................................................................................................................................................v

1 Scope ................................................................................................................................................................................................................................. 1

2 Normative references ...................................................................................................................................................................................... 1

3 Terms and definitions ..................................................................................................................................................................................... 1

4 Procedure for the handling of soil samples to be used in laboratory tests with

microorganisms, plants and invertebrates ............................................................................................................................... 2

4.1 Selection of sampling locations ................................................................................................................................................ 2

4.2 Performance of a preliminary survey .................................................................................................................................. 2

4.3 Description of field site .................................................................................................................................................................... 3

4.4 Sampling conditions ........................................................................................................................................................................... 3

4.5 Sampling methods ............................................................................................................................................................................... 3

4.6 Sample marking ..................................................................................................................................................................................... 3

4.7 Transportation conditions ............................................................................................................................................................ 3

4.8 Soil processing in the laboratory ............................................................................................................................................. 3

4.9 Storage conditions and storage periods ............................................................................................................................ 4

4.10 Pre-incubation ......................................................................................................................................................................................... 6

5 Sampling report..................................................................................................................................................................................................... 6

Bibliography ................................................................................................................................................................................................................................ 8

© ISO 2018 – All rights reserved iii
---------------------- Page: 3 ----------------------
ISO 18400-206:2018(E)
Foreword

ISO (the International Organization for Standardization) is a worldwide federation of national standards

bodies (ISO member bodies). The work of preparing International Standards is normally carried out

through ISO technical committees. Each member body interested in a subject for which a technical

committee has been established has the right to be represented on that committee. International

organizations, governmental and non-governmental, in liaison with ISO, also take part in the work.

ISO collaborates closely with the International Electrotechnical Commission (IEC) on all matters of

electrotechnical standardization.

The procedures used to develop this document and those intended for its further maintenance are

described in the ISO/IEC Directives, Part 1. In particular the different approval criteria needed for the

different types of ISO documents should be noted. This document was drafted in accordance with the

editorial rules of the ISO/IEC Directives, Part 2 (see www .iso .org/directives).

Attention is drawn to the possibility that some of the elements of this document may be the subject of

patent rights. ISO shall not be held responsible for identifying any or all such patent rights. Details of

any patent rights identified during the development of the document will be in the Introduction and/or

on the ISO list of patent declarations received (see www .iso .org/patents).

Any trade name used in this document is information given for the convenience of users and does not

constitute an endorsement.

For an explanation on the voluntary nature of standards, the meaning of ISO specific terms and

expressions related to conformity assessment, as well as information about ISO's adherence to the

World Trade Organization (WTO) principles in the Technical Barriers to Trade (TBT) see the following

URL: www .iso .org/iso/foreword .html.

This document was prepared by Technical Committee ISO/TC 190, Soil quality, Subcommittee SC 4,

Biological characterization.

This first edition of ISO 18400-206 cancels and replaces ISO 10381-6:2009, which has been technically

revised.
A list of all the parts in the ISO 18400 series can be found on the ISO website.

Any feedback or questions on this document should be directed to the user’s national standards body. A

complete listing of these bodies can be found at www .iso .org/members .html.
iv © ISO 2018 – All rights reserved
---------------------- Page: 4 ----------------------
ISO 18400-206:2018(E)
Introduction

Soils are both complex and heterogeneous because they consist of both living and non-living components

occurring in different combinations. Therefore, the condition of the soil, from collection to completion

of an experiment, is considered in this document in relation to effects on the soil organism community

(i.e. microorganisms, plants and invertebrates). Temperature, water content, availability of oxygen and

duration of storage are all known to affect these organisms, and thus the processes they mediate.

Soils can however be used effectively in the laboratory to investigate effects on soil organisms. In

this context a distinction is made between microbial communities on the one side and plants and

invertebrates on the other side, since the former are sampled as part of a soil sample, while the latter

are added to a soil sample (usually only a few selected species which have been identified as test species

beforehand). Therefore, this document covers two different issues:

a) It provides guidance on the collection, handling and storage of soil for laboratory use where aerobic

microbial activity is the main component of the study. It describes how to minimize the effects

of differences in temperature, water content and availability of oxygen on aerobic processes to

[1][2]
facilitate reproducible laboratory determinations .

b) It also provides guidance on the collection, handling and storage of soil for laboratory use where

the survival, reproduction, behaviour or growth of invertebrates or plants is the main components

of the study. It describes how to minimize the effects of differences in temperature, and the

water content as well as the fractionation of soil particles to facilitate reproducible laboratory

[1][2]
determinations .

This document is one of a group of standards dealing with various aspects of site investigation and

sampling. It needs to be used in conjunction with the other parts of ISO 18400. The role/position of the

standards within the total investigation programme is shown in Figure 1.
© ISO 2018 – All rights reserved v
---------------------- Page: 5 ----------------------
ISO 18400-206:2018(E)
Figure 1 — Links between the essential elements of an investigation programme

NOTE 1 The numbers in circles in Figure 1 define the single steps of the investigation programme.

NOTE 2 Figure 1 displays a generic process which can be amended when necessary.
vi © ISO 2018 – All rights reserved
---------------------- Page: 6 ----------------------
INTERNATIONAL STANDARD ISO 18400-206:2018(E)
Soil quality — Sampling —
Part 206:
Collection, handling and storage of soil under aerobic
conditions for the assessment of microbiological
processes, biomass and diversity in the laboratory
1 Scope

This document provides standard procedures for the collection, handling and storage of soil for

subsequent biological testing under aerobic conditions in the laboratory. It applies to the collection,

handling and storage for assessing the effects of soil on microorganisms, invertebrates (e.g. survival,

reproduction, growth, behaviour) and plants (e.g. development, growth). This document is not

applicable to the handling of soil where anaerobic conditions need to be maintained throughout.

This document describes how to minimize the effects of differences in temperature, water content,

and availability of oxygen on aerobic processes as well as the fractionation of soil particles to facilitate

[1][2]
reproducible laboratory determinations .

This document is mainly applicable to temperate soils. Soils collected from extreme climates (e.g.

permafrost, tropical soils) can require special handling.

NOTE This document does not provide standard procedures on the collection, handling and storage of soil

organisms when assessing the structure and function of soil organism communities in the field. Such standard

procedures are provided in ISO 23611-1 to ISO 23611-6.
2 Normative references

The following documents are referred to in the text in such a way that some or all of their content

constitutes requirements of this document. For dated references, only the edition cited applies. For

undated references, the latest edition of the referenced document (including any amendments) applies.

ISO 18400-101, Soil quality — Sampling — Part 101: Framework for the preparation and application of a

sampling plan
ISO 18400-107, Soil quality — Sampling — Part 107: Recording and reporting
ISO 18400-202, Soil quality — Sampling — Part 202: Preliminary investigations
3 Terms and definitions
For the purposes of this document, the following terms and definitions apply.

ISO and IEC maintain terminological databases for use in standardization at the following addresses:

— ISO Online browsing platform: available at https: //www .iso .org/obp
— IEC Electropedia: available at http: //www .electropedia .org/
3.1
aerobic
descriptive of a condition in which molecular oxygen is freely available
© ISO 2018 – All rights reserved 1
---------------------- Page: 7 ----------------------
ISO 18400-206:2018(E)
3.2
anaerobic
descriptive of a condition in which molecular oxygen is not available
3.3
water content on a dry mass basis

mass of water evaporating from the soil when dried to constant mass at 105 °C divided by the dry mass

of the soil and multiplied by 100
[SOURCE: ISO 11465:1993, 3.2]
4 Procedure for the handling of soil samples to be used in laboratory tests with
microorganisms, plants and invertebrates
4.1 Selection of sampling locations

The locations of the sites from which samples are taken should be selected according to the purpose of

the study, preliminary information, and on-site conditions. Sampling locations should be representative

of the total area to be sampled. These locations should be preferably geo-referenced. Sampling patterns

can be based on statistical models, numerical random distributions or systematic patterns as described

in ISO 18400-104. For details on the selection of sampling locations for sampling programmes with soil

invertebrates see also Reference [3].

NOTE It can be helpful to estimate the uncertainty of the measurement when soil sampling. Appropriate

statistical methods depend on the purpose and the design of the sampling (see ISO 18400-104).

Examples of on-site conditions that shall be considered when designing a sampling strategy include

local topography, climatic conditions, vegetation cover (especially trees), soil type and/or soil

physicochemical characteristics and, if appropriate, the location of a contaminant source (point or

non-point) or the direction of contamination. Soil properties as well as soil contamination are often

characterized by high variability in time and space. Thus, different designs and statistical methods

shall apply depending on the respective study objective.

Depending on the objective of the investigation a sampling pattern is chosen when designing the study

and is then applied in the field. Afterwards, preparation of the site includes the establishment of safety

measures (see also ISO 18400-103). When sampling if practicable, the locations should be marked so

that they can be used for comparative tests or to obtain further samples (e.g. at a later date). This work

becomes very time consuming if it is not possible to take a sample at the planned location due to a

variety of reasons (e.g. trees, rocks, or access difficulties). Contingency plans for dealing with such

situations should be made in advance (ad hoc decisions in the field can lead to a bias). The action taken

depends on the circumstances: the point can be ignored, or a nearby substitute location (e.g. within

10 % of grid spacing away from the original location) can be chosen. In every case when a sampling

point is re-located, this should be done in accordance with ISO 18400-101 and the reason for relocation

shall be clearly indicated in the report.
4.2 Performance of a preliminary survey

A preliminary investigation in accordance with ISO 18400-202 should be carried out prior to any

sampling programme, although the effort devoted to it depends on the objective of the investigation.

It should always comprise a desk-top study and a site visit. In addition, in the specific context of this

International Standard, a limited amount of sampling can be carried out provided that it is safe to do so.

The principal objectives of the preliminary study are to gain knowledge about the present condition of

the site, and of past activities on the site and adjacent land which can have affected it in order to enable

the sampling programme to be designed to be both technically effective and cost effective. In addition,

measures shall be identified that protect the health and safety of the investigating personnel and of the

environment (see ISO 18400-103).
2 © ISO 2018 – All rights reserved
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ISO 18400-206:2018(E)
4.3 Description of field site

Selection of a soil sampling site depends on the purpose of a particular study, and knowledge of the field

site history is always desirable. The site should be accurately described (including type and properties

of soil, designation of horizons) and its history given. Details of vegetation cover, the morphology of the

sampling area (e.g. flat area, slopes, steepness), and of chemical and biological additions or accidental

contamination, should be recorded and reported (see ISO 18400-107).
4.4 Sampling conditions

Soil required for studies conducted under laboratory conditions should, if practicable, be sampled in

the field with a soil water content which facilitates sieving. Sampling should, unless the purpose of the

study requires otherwise, be avoided during or immediately following long periods (e.g. one month) of

drought, freezing or flooding. If laboratory tests are to be used for field monitoring, conditions existing

in the field should be accepted.
4.5 Sampling methods

The sampling technique depends on the purpose of the study. Appropriate sampling techniques

should be selected and applied following the guidance in ISO 18400-102 and ISO 18400-205. If aerobic

agricultural soil is required, sampling is usually conducted to the actual ploughing depth. Any surface

vegetation cover, moss-covered litter layer, visible roots, large pieces of plant or woody plant

...

SLOVENSKI STANDARD
SIST ISO 18400-206:2019
01-marec-2019
1DGRPHãþD
SIST ISO 10381-6:2011

.DNRYRVWWDO9]RUþHQMHGHO=ELUDQMHUDYQDQMHLQVKUDQMHYDQMHY]RUFHYWDO

SULDHUREQLKSRJRMLK]DRFHQRPLNURELRORãNLKSURFHVRYELRPDVHLQUD]QROLNRVWLY
ODERUDWRULMX

Soil quality -- Sampling -- Part 206: Collection, handling and storage of soil under aerobic

conditions for the assessment of microbiological processes, biomass and diversity in the

laboratory

Qualité du sol - Échantillonnage - Partie 206: Collecte, manipulation et conservation de

sols destinés à l'évaluation de paramètres biologiques fonctionnels et structurels en

laboratoire
Ta slovenski standard je istoveten z: ISO 18400-206:2018
ICS:
13.080.05 Preiskava tal na splošno Examination of soils in
general
SIST ISO 18400-206:2019 en

2003-01.Slovenski inštitut za standardizacijo. Razmnoževanje celote ali delov tega standarda ni dovoljeno.

---------------------- Page: 1 ----------------------
SIST ISO 18400-206:2019
---------------------- Page: 2 ----------------------
SIST ISO 18400-206:2019
INTERNATIONAL ISO
STANDARD 18400-206
First edition
2018-10
Soil quality — Sampling —
Part 206:
Collection, handling and storage of
soil under aerobic conditions for
the assessment of microbiological
processes, biomass and diversity in
the laboratory
Qualité du sol — Échantillonnage —
Partie 206: Collecte, manipulation et conservation de sols destinés à
l'évaluation de paramètres biologiques fonctionnels et structurels en
laboratoire
Reference number
ISO 18400-206:2018(E)
ISO 2018
---------------------- Page: 3 ----------------------
SIST ISO 18400-206:2019
ISO 18400-206:2018(E)
COPYRIGHT PROTECTED DOCUMENT
© ISO 2018

All rights reserved. Unless otherwise specified, or required in the context of its implementation, no part of this publication may

be reproduced or utilized otherwise in any form or by any means, electronic or mechanical, including photocopying, or posting

on the internet or an intranet, without prior written permission. Permission can be requested from either ISO at the address

below or ISO’s member body in the country of the requester.
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Phone: +41 22 749 01 11
Fax: +41 22 749 09 47
Email: copyright@iso.org
Website: www.iso.org
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---------------------- Page: 4 ----------------------
SIST ISO 18400-206:2019
ISO 18400-206:2018(E)
Contents Page

Foreword ........................................................................................................................................................................................................................................iv

Introduction ..................................................................................................................................................................................................................................v

1 Scope ................................................................................................................................................................................................................................. 1

2 Normative references ...................................................................................................................................................................................... 1

3 Terms and definitions ..................................................................................................................................................................................... 1

4 Procedure for the handling of soil samples to be used in laboratory tests with

microorganisms, plants and invertebrates ............................................................................................................................... 2

4.1 Selection of sampling locations ................................................................................................................................................ 2

4.2 Performance of a preliminary survey .................................................................................................................................. 2

4.3 Description of field site .................................................................................................................................................................... 3

4.4 Sampling conditions ........................................................................................................................................................................... 3

4.5 Sampling methods ............................................................................................................................................................................... 3

4.6 Sample marking ..................................................................................................................................................................................... 3

4.7 Transportation conditions ............................................................................................................................................................ 3

4.8 Soil processing in the laboratory ............................................................................................................................................. 3

4.9 Storage conditions and storage periods ............................................................................................................................ 4

4.10 Pre-incubation ......................................................................................................................................................................................... 6

5 Sampling report..................................................................................................................................................................................................... 6

Bibliography ................................................................................................................................................................................................................................ 8

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SIST ISO 18400-206:2019
ISO 18400-206:2018(E)
Foreword

ISO (the International Organization for Standardization) is a worldwide federation of national standards

bodies (ISO member bodies). The work of preparing International Standards is normally carried out

through ISO technical committees. Each member body interested in a subject for which a technical

committee has been established has the right to be represented on that committee. International

organizations, governmental and non-governmental, in liaison with ISO, also take part in the work.

ISO collaborates closely with the International Electrotechnical Commission (IEC) on all matters of

electrotechnical standardization.

The procedures used to develop this document and those intended for its further maintenance are

described in the ISO/IEC Directives, Part 1. In particular the different approval criteria needed for the

different types of ISO documents should be noted. This document was drafted in accordance with the

editorial rules of the ISO/IEC Directives, Part 2 (see www .iso .org/directives).

Attention is drawn to the possibility that some of the elements of this document may be the subject of

patent rights. ISO shall not be held responsible for identifying any or all such patent rights. Details of

any patent rights identified during the development of the document will be in the Introduction and/or

on the ISO list of patent declarations received (see www .iso .org/patents).

Any trade name used in this document is information given for the convenience of users and does not

constitute an endorsement.

For an explanation on the voluntary nature of standards, the meaning of ISO specific terms and

expressions related to conformity assessment, as well as information about ISO's adherence to the

World Trade Organization (WTO) principles in the Technical Barriers to Trade (TBT) see the following

URL: www .iso .org/iso/foreword .html.

This document was prepared by Technical Committee ISO/TC 190, Soil quality, Subcommittee SC 4,

Biological characterization.

This first edition of ISO 18400-206 cancels and replaces ISO 10381-6:2009, which has been technically

revised.
A list of all the parts in the ISO 18400 series can be found on the ISO website.

Any feedback or questions on this document should be directed to the user’s national standards body. A

complete listing of these bodies can be found at www .iso .org/members .html.
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ISO 18400-206:2018(E)
Introduction

Soils are both complex and heterogeneous because they consist of both living and non-living components

occurring in different combinations. Therefore, the condition of the soil, from collection to completion

of an experiment, is considered in this document in relation to effects on the soil organism community

(i.e. microorganisms, plants and invertebrates). Temperature, water content, availability of oxygen and

duration of storage are all known to affect these organisms, and thus the processes they mediate.

Soils can however be used effectively in the laboratory to investigate effects on soil organisms. In

this context a distinction is made between microbial communities on the one side and plants and

invertebrates on the other side, since the former are sampled as part of a soil sample, while the latter

are added to a soil sample (usually only a few selected species which have been identified as test species

beforehand). Therefore, this document covers two different issues:

a) It provides guidance on the collection, handling and storage of soil for laboratory use where aerobic

microbial activity is the main component of the study. It describes how to minimize the effects

of differences in temperature, water content and availability of oxygen on aerobic processes to

[1][2]
facilitate reproducible laboratory determinations .

b) It also provides guidance on the collection, handling and storage of soil for laboratory use where

the survival, reproduction, behaviour or growth of invertebrates or plants is the main components

of the study. It describes how to minimize the effects of differences in temperature, and the

water content as well as the fractionation of soil particles to facilitate reproducible laboratory

[1][2]
determinations .

This document is one of a group of standards dealing with various aspects of site investigation and

sampling. It needs to be used in conjunction with the other parts of ISO 18400. The role/position of the

standards within the total investigation programme is shown in Figure 1.
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ISO 18400-206:2018(E)
Figure 1 — Links between the essential elements of an investigation programme

NOTE 1 The numbers in circles in Figure 1 define the single steps of the investigation programme.

NOTE 2 Figure 1 displays a generic process which can be amended when necessary.
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INTERNATIONAL STANDARD ISO 18400-206:2018(E)
Soil quality — Sampling —
Part 206:
Collection, handling and storage of soil under aerobic
conditions for the assessment of microbiological
processes, biomass and diversity in the laboratory
1 Scope

This document provides standard procedures for the collection, handling and storage of soil for

subsequent biological testing under aerobic conditions in the laboratory. It applies to the collection,

handling and storage for assessing the effects of soil on microorganisms, invertebrates (e.g. survival,

reproduction, growth, behaviour) and plants (e.g. development, growth). This document is not

applicable to the handling of soil where anaerobic conditions need to be maintained throughout.

This document describes how to minimize the effects of differences in temperature, water content,

and availability of oxygen on aerobic processes as well as the fractionation of soil particles to facilitate

[1][2]
reproducible laboratory determinations .

This document is mainly applicable to temperate soils. Soils collected from extreme climates (e.g.

permafrost, tropical soils) can require special handling.

NOTE This document does not provide standard procedures on the collection, handling and storage of soil

organisms when assessing the structure and function of soil organism communities in the field. Such standard

procedures are provided in ISO 23611-1 to ISO 23611-6.
2 Normative references

The following documents are referred to in the text in such a way that some or all of their content

constitutes requirements of this document. For dated references, only the edition cited applies. For

undated references, the latest edition of the referenced document (including any amendments) applies.

ISO 18400-101, Soil quality — Sampling — Part 101: Framework for the preparation and application of a

sampling plan
ISO 18400-107, Soil quality — Sampling — Part 107: Recording and reporting
ISO 18400-202, Soil quality — Sampling — Part 202: Preliminary investigations
3 Terms and definitions
For the purposes of this document, the following terms and definitions apply.

ISO and IEC maintain terminological databases for use in standardization at the following addresses:

— ISO Online browsing platform: available at https: //www .iso .org/obp
— IEC Electropedia: available at http: //www .electropedia .org/
3.1
aerobic
descriptive of a condition in which molecular oxygen is freely available
© ISO 2018 – All rights reserved 1
---------------------- Page: 9 ----------------------
SIST ISO 18400-206:2019
ISO 18400-206:2018(E)
3.2
anaerobic
descriptive of a condition in which molecular oxygen is not available
3.3
water content on a dry mass basis

mass of water evaporating from the soil when dried to constant mass at 105 °C divided by the dry mass

of the soil and multiplied by 100
[SOURCE: ISO 11465:1993, 3.2]
4 Procedure for the handling of soil samples to be used in laboratory tests with
microorganisms, plants and invertebrates
4.1 Selection of sampling locations

The locations of the sites from which samples are taken should be selected according to the purpose of

the study, preliminary information, and on-site conditions. Sampling locations should be representative

of the total area to be sampled. These locations should be preferably geo-referenced. Sampling patterns

can be based on statistical models, numerical random distributions or systematic patterns as described

in ISO 18400-104. For details on the selection of sampling locations for sampling programmes with soil

invertebrates see also Reference [3].

NOTE It can be helpful to estimate the uncertainty of the measurement when soil sampling. Appropriate

statistical methods depend on the purpose and the design of the sampling (see ISO 18400-104).

Examples of on-site conditions that shall be considered when designing a sampling strategy include

local topography, climatic conditions, vegetation cover (especially trees), soil type and/or soil

physicochemical characteristics and, if appropriate, the location of a contaminant source (point or

non-point) or the direction of contamination. Soil properties as well as soil contamination are often

characterized by high variability in time and space. Thus, different designs and statistical methods

shall apply depending on the respective study objective.

Depending on the objective of the investigation a sampling pattern is chosen when designing the study

and is then applied in the field. Afterwards, preparation of the site includes the establishment of safety

measures (see also ISO 18400-103). When sampling if practicable, the locations should be marked so

that they can be used for comparative tests or to obtain further samples (e.g. at a later date). This work

becomes very time consuming if it is not possible to take a sample at the planned location due to a

variety of reasons (e.g. trees, rocks, or access difficulties). Contingency plans for dealing with such

situations should be made in advance (ad hoc decisions in the field can lead to a bias). The action taken

depends on the circumstances: the point can be ignored, or a nearby substitute location (e.g. within

10 % of grid spacing away from the original location) can be chosen. In every case when a sampling

point is re-located, this should be done in accordance with ISO 18400-101 and the reason for relocation

shall be clearly indicated in the report.
4.2 Performance of a preliminary survey

A preliminary investigation in accordance with ISO 18400-202 should be carried out prior to any

sampling programme, although the effort devoted to it depends on the objective of the investigation.

It should always comprise a desk-top study and a site visit. In addition, in the specific context of this

International Standard, a limited amount of sampling can be carried out provided that it is safe to do so.

The principal objectives of the preliminary study are to gain knowledge about the present condition of

the site, and of past activities on the site and adjacent land which can have affected it in order to enable

the sampling programme to be designed to be both technically effective and cost effective. In addition,

measures shall be identified that protect the health and safety of the investigating personnel and of the

environment (see ISO 18400-103).
2 © ISO 2018 – All rights reserved
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SIST ISO 18400-206:2019
ISO 18400-206:2018(E)
4.3 Description of field site

Selection of a soil sampling site depends on the purpose of a particular study, and knowledge of the field

site history is always desirable. The site should be accurately described (including type and properties

of soil, designation of horizons) and its history given. Details of vegetation cover, the morphology of the

sampling area (e.g. flat area, slopes, steepness), and of chemical and biological additions or accidental

contamination, should be recorded and reported (see ISO 18400-107).
4.4 Sampling conditions

Soil required for studies conducted under laboratory conditions should, if practicable, be sampled in

the field with a soil water content which facilitates sieving. Sampling should, unless the purpose of the

study requires otherwise, be a
...

NORME ISO
INTERNATIONALE 18400-206
Première édition
2018-10
Qualité du sol — Échantillonnage —
Partie 206:
Collecte, manipulation et conservation
de sols destinés à l'évaluation de
paramètres biologiques fonctionnels
et structurels en laboratoire
Soil quality — Sampling —
Part 206: Collection, handling and storage of soil under aerobic
conditions for the assessment of microbiological processes, biomass
and diversity in the laboratory
Numéro de référence
ISO 18400-206:2018(F)
ISO 2018
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ISO 18400-206:2018(F)
DOCUMENT PROTÉGÉ PAR COPYRIGHT
© ISO 2018

Tous droits réservés. Sauf prescription différente ou nécessité dans le contexte de sa mise en œuvre, aucune partie de cette

publication ne peut être reproduite ni utilisée sous quelque forme que ce soit et par aucun procédé, électronique ou mécanique,

y compris la photocopie, ou la diffusion sur l’internet ou sur un intranet, sans autorisation écrite préalable. Une autorisation peut

être demandée à l’ISO à l’adresse ci-après ou au comité membre de l’ISO dans le pays du demandeur.

ISO copyright office
Case postale 401 • Ch. de Blandonnet 8
CH-1214 Vernier, Genève
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Fax: +41 22 749 09 47
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Web: www.iso.org
Publié en Suisse
ii © ISO 2018 – Tous droits réservés
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ISO 18400-206:2018(F)
Sommaire Page

Avant-propos ..............................................................................................................................................................................................................................iv

Introduction ..................................................................................................................................................................................................................................v

1 Domaine d'application ................................................................................................................................................................................... 1

2 Références normatives ................................................................................................................................................................................... 1

3 Termes et définitions ....................................................................................................................................................................................... 1

4 Procédure de manipulation d'échantillons de sol destinés à être utilisés en

laboratoire pour l'étude de micro-organismes, de végétaux et d'invertébrés ....................................2

4.1 Choix des sites de prélèvement ................................................................................................................................................ 2

4.2 Réalisation d'une étude préliminaire .................................................................................................................................. 2

4.3 Description du site de prélèvement ...................................................................................................................................... 3

4.4 Conditions d’échantillonnage ..................................................................................................................................................... 3

4.5 Méthodes d'échantillonnage ....................................................................................................................................................... 3

4.6 Étiquetage des échantillons ......................................................................................................................................................... 3

4.7 Conditions de transport .................................................................................................................................................................. 3

4.8 Traitement des échantillons de sols au laboratoire ................................................................................................ 4

4.9 Conditions et durées de conservation ................................................................................................................................ 4

4.10 Pré-incubation ......................................................................................................................................................................................... 6

5 Rapport d'échantillonnage ........................................................................................................................................................................ 6

Bibliographie .............................................................................................................................................................................................................................. 8

© ISO 2018 – Tous droits réservés iii
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ISO 18400-206:2018(F)
Avant-propos

L'ISO (Organisation internationale de normalisation) est une fédération mondiale d'organismes

nationaux de normalisation (comités membres de l'ISO). L'élaboration des Normes internationales est

en général confiée aux comités techniques de l'ISO. Chaque comité membre intéressé par une étude

a le droit de faire partie du comité technique créé à cet effet. Les organisations internationales,

gouvernementales et non gouvernementales, en liaison avec l'ISO participent également aux travaux.

L'ISO collabore étroitement avec la Commission électrotechnique internationale (IEC) en ce qui

concerne la normalisation électrotechnique.

Les procédures utilisées pour élaborer le présent document et celles destinées à sa mise à jour sont

décrites dans les Directives ISO/IEC, Partie 1. Il convient, en particulier de prendre note des différents

critères d'approbation requis pour les différents types de documents ISO. Le présent document a été

rédigé conformément aux règles de rédaction données dans les Directives ISO/IEC, Partie 2 (voir www

.iso .org/directives).

L'attention est attirée sur le fait que certains des éléments du présent document peuvent faire l'objet de

droits de propriété intellectuelle ou de droits analogues. L'ISO ne saurait être tenue pour responsable

de ne pas avoir identifié de tels droits de propriété et averti de leur existence. Les détails concernant

les références aux droits de propriété intellectuelle ou autres droits analogues identifiés lors de

l'élaboration du document sont indiqués dans l'Introduction et/ou dans la liste des déclarations de

brevets reçues par l’ISO (voir www .iso .org/brevets).

Les appellations commerciales éventuellement mentionnées dans le présent document sont données

pour information, par souci de commodité à l'intention des utilisateurs et ne sauraient constituer un

engagement.

Pour une explication de la nature volontaire des normes, la signification des termes et expressions

spécifiques de l'ISO liés à l'évaluation de la conformité, ou pour toute information au sujet de l'adhésion

de l'ISO aux principes de l'Organisation mondiale du commerce (OMC) concernant les obstacles

techniques au commerce (OTC) voir le lien suivant: www .iso .org/iso/fr/avant -propos .html.

Le présent document a été élaboré par le comité technique ISO/TC 190, Qualité du sol, sous-comité SC 4,

Caractérisation biologique.

Cette première édition de l’ISO 18400-206 annule et remplace l’ISO 10381-6:2009, qui a fait l’objet d’une

révision technique.

Une liste de toutes les parties de la série ISO 18400 se trouve sur le site Web de l’ISO.

Il convient que l’utilisateur adresse tout retour d’information ou toute question concernant le présent

document à l’organisme national de normalisation de son pays. Une liste exhaustive desdits organismes

se trouve à l’adresse www .iso .org/fr/members .html.
iv © ISO 2018 – Tous droits réservés
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ISO 18400-206:2018(F)
Introduction

Les sols sont à la fois complexes et hétérogènes car ils se composent d'éléments biotiques et abiotiques

se présentant sous des combinaisons diverses. L'état du sol, de sa collecte à l'aboutissement d'une

expérience, est donc pris en compte dans le présent document tout en observant les répercussions que

ces pratiques peuvent avoir sur la communauté des organismes du sol (c'est-à-dire micro-organismes,

végétaux et invertébrés). Il est bien connu que la température, la teneur en eau, la disponibilité

en oxygène et la durée de conservation affectent ces organismes et par conséquent, les processus

microbiens qui en résultent.

Les sols peuvent néanmoins être employés de manière efficace au laboratoire afin d'étudier les effets sur

les organismes du sol. Dans ce contexte, une distinction est faite entre les communautés microbiennes

d'une part et les végétaux et les invertébrés d'autre part, car les communautés microbiennes sont

prélevées en tant que partie intégrante d'un échantillon de sol, alors que les végétaux et les invertébrés

sont ajoutés à un échantillon de sol (en général, seules quelques espèces sélectionnées ont été

préalablement identifiées en tant qu'espèces devant être utilisées pour les analyses). Par conséquent, le

présent document traite de deux sujets différents:

a) il propose des lignes directrices relatives à la collecte, la manipulation et la conservation de sols

destinés principalement à l'étude en laboratoire de l'activité microbienne aérobie. Il décrit comment

réduire les conséquences des différences de température, de la teneur en eau et en oxygène

[1][2]

disponible sur les processus aérobies afin d'obtenir des mesures reproductibles en laboratoire ;

b) il propose également des lignes directrices relatives à la collecte, la manipulation et la conservation

de sols destinés principalement à l'étude en laboratoire de la survie, de la reproduction, du

comportement ou de la croissance d'invertébrés ou de végétaux. Il décrit comment réduire les

conséquences des différences de température, et de la teneur en eau ainsi que le fractionnement

[1][2]
des particules du sol afin d'obtenir des mesures reproductibles en laboratoire .

Le présent document fait partie d'un ensemble de normes traitant de divers aspects de l'investigation

et de l'échantillonnage de sites. Il convient de l'utiliser conjointement avec les autres parties de

l'ISO 18400. Le rôle/le positionnement des normes au sein de l'ensemble du programme d'investigation

est illustré(e) à la Figure 1.
© ISO 2018 – Tous droits réservés v
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ISO 18400-206:2018(F)
Figure 1 — Liens entre les éléments essentiels d’un programme d’investigation

NOTE 1 Les chiffres figurant dans les cercles à la Figure 1 définissent les étapes distinctes du programme

d'investigation.

NOTE 2 La Figure 1 présente un processus générique qui peut être modifié si nécessaire.

vi © ISO 2018 – Tous droits réservés
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NORME INTERNATIONALE ISO 18400-206:2018(F)
Qualité du sol — Échantillonnage —
Partie 206:
Collecte, manipulation et conservation de sols destinés
à l'évaluation de paramètres biologiques fonctionnels et
structurels en laboratoire
1 Domaine d'application

Le présent document fournit des procédures normalisées pour la collecte, la manipulation et la

conservation, dans des conditions aérobies, de sols destinés à des essais biologiques en laboratoire. Il

s'applique à la collecte, la manipulation et la conservation de sols pour l'évaluation de leurs effets sur

les micro-organismes, les invertébrés (par exemple survie, reproduction, croissance, comportement)

et les végétaux (par exemple développement, croissance). Le présent document ne s'applique pas à la

manipulation de sols lorsque des conditions anaérobies doivent être maintenues en permanence.

Le présent document décrit comment réduire les conséquences des différences de température,

de teneur eau et en oxygène disponible sur les processus aérobies, ainsi que le fractionnement des

[1][2]
particules du sol, afin d'obtenir des mesures reproductibles en laboratoire .

Le présent document s'applique principalement aux sols tempérés. Les sols collectés dans des lieux

où les climats sont extrêmes (par exemple le pergélisol, les sols tropicaux) peuvent nécessiter une

manipulation particulière.

NOTE Le présent document ne propose pas de procédures normalisées pour la collecte, la manipulation

et la conservation d'organismes du sol lors de l'évaluation de la structure et de la fonction de communautés

d'organismes du sol sur le terrain. De telles procédures normalisées sont fournies dans l‘ISO 23611-1 à

l’ISO 23611-6.
2 Références normatives

Les documents suivants cités dans le texte constituent, pour tout ou partie de leur contenu, des

exigences du présent document. Pour les références datées, seule l'édition citée s'applique. Pour les

références non datées, la dernière édition du document de référence s'applique (y compris les éventuels

amendements).

ISO 18400-101, Qualité du sol — Échantillonnage — Partie 101: Cadre pour la préparation et l'application

d'un plan d'échantillonnage

ISO 18400-107, Qualité du sol — Échantillonnage — Partie 107: Enregistrement et notification

ISO 18400-202, Qualité du sol — Échantillonnage — Partie 202: Diagnostics préliminaires

3 Termes et définitions

Pour les besoins du présent document, les termes et définitions suivants s'appliquent.

L'ISO et l'IEC tiennent à jour des bases de données terminologiques destinées à être utilisées en

normalisation, consultables aux adresses suivantes:

— ISO Online browsing platform: disponible à l'adresse https: //www .iso .org/obp

— IEC Electropedia: disponible à l'adresse http: //www .electropedia .org/
© ISO 2018 – Tous droits réservés 1
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ISO 18400-206:2018(F)
3.1
aérobie

description d'un état se caractérisant par une libre disponibilité de l'oxygène moléculaire

3.2
anaérobie
description d'un état se caractérisant par une absence d'oxygène moléculaire
3.3
teneur en eau pondérale

masse d'eau qui s'évapore du sol lorsqu'il est séché jusqu'à masse constante à 105 °C, divisée par la

masse de sol sec et multipliée par 100
[SOURCE: ISO 11465:1993, 3.2]
4 Procédure de manipulation d'échantillons de sol destinés à être utilisés en
laboratoire pour l'étude de micro-organismes, de végétaux et d'invertébrés
4.1 Choix des sites de prélèvement

Il convient de choisir les sites de prélèvement des échantillons en fonction des objectifs de l'étude, des

informations préliminaires et des conditions sur le terrain. Il convient que les sites de prélèvement

soient représentatifs de l'ensemble de la zone étudiée. Il convient, de préférence, que le repérage de

ces sites soit un repérage à référence spatiale. Les grilles d'échantillonnage peuvent être basées

sur des modèles statistiques, des distributions de variables aléatoires numériques ou des grilles

d'échantillonnage systématique telles que décrites dans l'ISO 18400-104. Pour plus de détails sur le

choix des sites de prélèvement pour des programmes d'échantillonnage portant sur les invertébrés du

sol, voir également la Référence [3].

NOTE Il peut être utile d'estimer l'incertitude de mesure lors de l'échantillonnage de sols. Les méthodes

statistiques appropriées dépendent de l'objectif et de la conception de l'échantillonnage (voir l'ISO 18400-104).

Les exemples de conditions de terrain qui doivent être prises en compte lors de la conception d'une

stratégie d'échantillonnage comprennent la topographie locale, les conditions climatiques, la couverture

végétale (notamment les arbres), le type de sol et/ou les caractéristiques physico-chimiques et, le cas

échéant, l'emplacement d'une source de contamination (ponctuelle ou non ponctuelle) ou la direction

de la contamination. Les propriétés des sols ainsi que la contamination des sols sont caractérisées par

une grande variabilité dans le temps et dans l'espace. Par conséquent, les différentes conceptions et

méthodes statistiques doivent être appliquées en fonction de l'objectif respectif de l'étude.

Selon l'objectif de l'investigation, une grille d'échantillonnage est choisie lors de la conception de

l'étude, puis appliquée sur le terrain. Ensuite, la préparation du site inclut la mise en œuvre de mesures

de sécurité (voir également l'ISO 18400-103). Lorsque l'échantillonnage est réalisable, il convient de

repérer les sites afin de pouvoir les utiliser dans le cadre d'essais comparatifs ou de prélever d'autres

échantillons (par exemple à une date ultérieure). Ce travail devient très fastidieux si, pour diverses

raisons (par exemple présence d'arbres, de rochers ou difficultés d'accès), il n'est pas possible de prélever

un échantillon à l'emplacement prévu. Il convient donc que des plans d'intervention soient préparés à

l'avance pour gérer ce type de situation (des décisions ad-hoc prises sur le terrain peuvent conduire à un

biais). L'action à entreprendre dépend des circonstances: il est possible d'ignorer un point ou de choisir

un emplacement de substitution situé à proximité (par exemple, situé à moins de 10 % de l'espacement

des mailles par rapport à l'emplacement initial). Dans tous les cas, lorsqu'un point d'échantillonnage est

déplacé, il convient que ce déplacement soit effectué conformément à l'ISO 18400-101 et que les raisons

qui ont conduit à ce déplacement soient clairement indiquées dans le rapport d'échantillonnage.

4.2 Réalisation d'une étude préliminaire

Il convient d'effectuer une investigation préliminaire conformément à l'ISO 18400-202 avant d'établir

tout programme d'échantillonnage, bien que l'ampleur du travail qui lui est consacré dépende de

2 © ISO 2018 – Tous droits réservés
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ISO 18400-206:2018(F)

l'objectif de l'investigation. Il convient que l'étude préliminaire comprenne une recherche documentaire

et une visite du site. En outre, dans le contexte spécifique de la présente Norme internationale, l'ampleur

de l'échantillonnage peut être limitée sous réserve que cela puisse être fait en toute sécurité. Les

principaux objectifs de l'étude préliminaire sont les suivants: l'acquisition de connaissances sur l'état

actuel du site et les activités antérieures sur le site et sur les terrains voisins qui auraient pu affecter le

site afin de pouvoir concevoir un programme d'échantillonnage qui soit à la fois efficace techniquement

et rentable en terme de coûts. En outre, il est nécessaire d'identifier les mesures qui doivent être prises

pour protéger la santé et assurer la sécurité des personnes intervenant sur le site dans le cadre de

l'investigation et pour protéger l'environnement (voir l’ISO 18400-103).
4.3 Description du site de prélèvement

Le choix du site de prélèvement de sol dépend de l'étude particulière envisagée et il est toujours

préférable de connaître l'historique du site de prélèvement. Il convient de décrire le site de manière

précise (y compris le type et les propriétés du sol, la désignation des horizons) et d'en fournir

l'historique. Il convient également d'enregistrer et de noter dans le rapport d'essai les détails relatifs

à la couverture végétale, à la morphologie du site d'échantillonnage (par exemple s'il s'agit d'une zone

plane, de pentes, d'inclinaisons), ainsi que les détails relatifs aux traitements chimiques et biologiques

et à toute pollution accidentelle (voir l’ISO 18400-107).
4.4 Conditions d’échantillonnage

Il convient, dans la mesure du possible, de prélever le sol nécessaire aux études en laboratoire sur

le site avec une teneur en eau du sol facilitant son tamisage. Il convient donc d'éviter de prélever des

échantillons pendant de longues périodes (un mois par exemple), de sécheresse, de gel ou d'inondation

ou juste après, à moins que les besoins de l'étude n'exigent de procéder différemment. Si les essais en

laboratoire ont pour objet la surveillance du lieu de prélèvement, il convient de respecter les conditions

telles qu'elles existent sur le terrain.
4.5 Méthodes d'échantillonnage

La technique d'échantillonnage dépend des objectifs de l'étude. Il convient que des techniques

d'échantillonnage appropriées soient choisies et appliquées suivant les lignes directrices données dans

l'ISO 18400-102 et l’ISO 18400-205. S'il est nécessaire d'utiliser du sol agricole aérobie, il est en général

échantillonné à la profondeur de labour. Il convient d'éliminer la couverture végétale, la litière, les racines

apparentes, les morceaux de plante importants ou les débris ligneux et la faune du sol apparente afin

de réduire l'apport de carbone organique frais au sol. En effet, l'introduction de composés organiques

provenant de racines ou d'autres sources peut provoquer des changements imprévisibles de l'activité et

de la composition de la microfl
...

Questions, Comments and Discussion

Ask us and Technical Secretary will try to provide an answer. You can facilitate discussion about the standard in here.